姑苏城有一个叫白钟文的名医，他膝下有一儿一女，都通医术，但白钟文认为女子无才便是德，从来不让女儿珍珠行医。
这一年珍珠十六岁，邻县的大富商朱杰来姑苏做生意，因水土不服病倒了，就慕名来到白家医馆寻医。刚巧当时白钟文出门问诊去了，珍珠见机会难得，就央求哥哥让她当一回郎中。朱杰看不起她年幼，就傲慢地让她请家里的大人出来，谁知珍珠不慌不忙地说：“牡丹纵好空入目，枣花虽小结实成。欺老莫欺少，欺人心不明。蒿草之下，或有兰香，沙砾之中，或有珍珠！”朱杰一听，不由心中一动，他于是摸摸胡子笑道：“好吧，我就让你为我问诊，如果你真有两下子，我就服了你。”珍珠听了，淡淡一笑，不卑不亢地为朱杰问闻望切，并开了药方。
朱杰接了药方直接就去了药铺，那药铺掌柜一接过药方，倒惊讶了：“哟，白郎中医术更进一层了，只加了这一味药，倒是让所有的药效提高了一倍呢！”朱杰听了还不信，不想回去后只一服药，病就好了许多。他不由暗暗称奇，第二天，他又去了钟家医馆，这次是白钟文亲自为他问诊，开出的药方果然少一味药材，服用后的药效也大不如前。
这一来二去的，朱杰便喜欢上了珍珠，他想起自己的儿子朱昌跟珍珠年龄相仿，干脆带着贵重的聘礼去钟家为儿子求亲。白钟文早听说过邻县朱家家大业大，不由喜出望外，毫不犹豫地就答应了这门亲事。因两家孩子尚且年幼，双方约定两年后再办婚事。
朱家送来的信物是一颗罕见的紫珍珠，大如橄榄，亮中带紫，据说是产于东海的宝物，珍珠十分喜欢。但她仍有些不放心，她悄悄地托哥哥去打听那朱昌的人品，当得知朱昌是个知书达礼、饱读诗书的好少年时，一颗悬着的心才放下了，她的心中从此也多了一丝牵挂。
岁月如梭，转眼两年过去了，珍珠已长成了一个大姑娘，出落得十分端庄美貌，那边也传来消息，说朱昌今年已在乡试中中了举。
然而，就在两家欢天喜地地筹备婚礼的时候，朱家被人陷害，突然吃了官司，家产一夜之间尽数充公，一家人差点流落街头。一家人横遭此难，只得托人带信给白钟文，说暂时无力迎娶珍珠，婚期可能要延后。珍珠知道后，偷偷地哭了好几回，而白钟文却趁机怂恿女儿退婚，珍珠痛恨父亲忘恩负义，却又无计可施。
有道是福无双至，祸不单行，就在珍珠想办法说服父亲时，更大的噩耗传来了——朱家所住的那个镇子上染上了瘟疫，死了不少人，整个镇子都被官府封锁了，朱家上下只有等死的份了！出了这样的事，白钟文说什么也不会同意珍珠死守下去了，他甚至已经开始托媒人给珍珠重新物色人家。珍珠不由心急如焚，她觉得不能再这样等下去了，哪怕是死，她也要去见朱昌一面。当天晚上，在哥哥的帮助下，珍珠骑着马连夜逃出了家门。
赶了一天一夜的路，到了第二天傍晚时分，珍珠总算到了邻县的朱家镇，到了那儿她也发现，事情远比她想象的更严重。朱家镇的各个出口都已被一人多高的荆棘墙封住了，另外还驻守着大批官兵，不准人进出，镇子里的百姓都涌在路口嚎哭。官兵们却都远远地捂住口鼻，眼中只有漠然。
珍珠来到一个路口，正想上前与官兵交涉，荆棘墙那边突然窜出来一匹高大的马，马上坐着一个容貌俊秀的男子。官兵们见了，忙提刀上前阻止这一人一马，那马受惊，猛然一个朝天蹬，将男子摔倒在地，男子连忙爬起身欲跑，但官兵仗着人多，很快将他包围起来。
珍珠眼看这男子要吃亏，她顾不得多想，忙驱马上前，伸手将男子拉上了马，并快速离开了路口，把官兵远远地甩在了后面。官兵见追不上他们，竟取箭搭弓，顿时，箭如飞蝗般射向了他们，两人为躲飞箭，只得相拥着伏在马背上。
好不容易出了城区，男子下马向她道谢，发现珍珠的脸十分苍白，她解释说是受了惊吓，男子向她抱拳，说大恩容日后相报，而此刻他有要事在身，需要立刻动身，于是两人挥手告别。
珍珠眼看着那男子的身影越来越远，她忽然伏在马背上痛苦地呻吟着，原来她在刚才逃跑的过程中，中了一箭，只见珍珠反手握住箭柄，一咬牙将箭折断了。接着，她从随身的包裹里取出了一点金创药，敷在了伤口上。她躺在路边休息了一会儿，竟睡过去了，也不知过了多久，她才悠悠醒来，自已觉得精神好了许多，就又往城中去了，她高一脚低一脚的赶路，竟然忘了骑马。
天黑时，珍珠来到另一条通往镇里的路口，这条路口上同样是荆棘墙挡路，官兵把守，荆棘墙那边涌集着许多举着火把的百姓。她正思索怎样才能进去，却看到那边有个半大的男孩突然拼了命的从荆棘墙的缝隙中往外爬，很快他的身上就被划得鲜血直流，可他还是硬从荆棘缝里钻了过来，当他兴奋地以为获得了新生的时候，官兵们突然冲过去，一顿乱刀把他砍死了，这还不算，他们又把男孩的尸体抛进了荆棘那边。老百姓不由发出愤怒的吼声，不时以乱石投掷官兵，官兵又避得远远的，不再理他们。这时，一个妇人抱着一个婴儿，“扑通”一声跪倒在地，冲官兵哀求道：“各位官爷，我的孩子还小，他并没有染病，请您们把他抱过去，随便给谁抱养，只要能保住他的一条命就行了！”说完她拼命地磕着头，只希望能打动谁能救她的孩子一命，然而，官兵只是嫌恶地看了她一眼，就自顾聊起天来。
珍珠远远望去，见百姓都神清体健的，比想象中的要好上许多，但他们现在都被一种深深的恐惧和绝望包围着，时间长了，也是一件危险的事。于是她上前告诉官兵，她要进城。
听说珍珠要进城，官兵都很惊讶，因为自打封城以来，她是第一个要从外面进去的人，但他们还是借口怕百姓闹事，不肯答应她的要求。珍珠没有办法，她看了看刚才那男孩爬出的那个洞，她先把包裹塞了进去，然后就从那个洞里钻了进去，怪得是她身上竟然并没有受伤。一时间，大家都怔怔地望着她，人们不明白，这个时候大家都对他们避之不及，怎么还有人主动走进城来？
珍珠顾不得许多了，她对大家笑了笑：“你们好，我是姑苏来的白珍珠，是特地赶来为你们治病的！”“白珍珠？你是朱昌的未婚妻、邻县白大夫的女儿吗？朱昌下午刚出去找你，你这么快就来了？” “你来了，我们镇子就有希望了。”“朱老先生常跟人们谈起你，我带你去他们家吧，他病了。”在大家七嘴八舌的话语中，珍珠才知道，原来朱昌刚刚飞马逃出城去找她求助去了。她不由暗想：难道我刚才所救的男子就是朱昌？她连忙问了众人朱昌的长相，还真跟她刚才所救的男子一致，原来朱昌正是要赶往邻县找白家求助。一时间，珍珠不由百感交集，一想起刚才与未婚夫在马背上生死与共的场景，她的心里不由升起一股暖意。
不过眼下她还没有时间甜蜜，她忙从身上取出一块丝帕蒙上口鼻，并让大家也这样做，她告诉大家这样可以防止疾病传播。
走进镇子，人们远远地向她指了指河边的一所阴暗的旧房子，珍珠上前推开了那扇虚掩的门，众人远远地站着。
屋里很暗，只点着一盏油灯，朱杰虚弱地躺在床上，只剩下一口气了，听到脚步声，他睁开眼睛看了看珍珠，脸上露出欣喜之色。珍珠忙以儿媳之礼见过了公公，接着，她为公公搭了脉，还好，病情不如想象中的严重，她在镇上的药铺里找到了一些治病的药，只是苦于没有药引。情急之下，珍珠从怀中掏出了那颗定亲的珍珠，将它辗碎了作为药引，然后将熬好的药撒进了镇上的所有的水井，让全镇老少饮用。
白珍珠的高明医术加上紫珍珠的良好药效，瘟疫很快得到了控制，两天后，一些重症病人也开始渐渐康复，珍珠便和镇上百姓来到被封的路口，恳求官府收回成命，撤销对镇子的封锁。官府听说了这件事， 十分震惊，马上派人来调查了，当听说疫情是被珍珠控制的，马上撤去了所有封锁，并送给她一块“巾帼华佗”的牌匾。
再说朱昌，他当日得珍珠相救，后来赶往姑苏求助，却被白钟文一顿冷嘲热讽。只得悲愤交加地往回赶，幸亏在路上听说了珍珠已控制了瘟疫的好消息，这才兴冲冲地赶了回来，街坊们还特地为他们的相见安排了一个浪漫的氛围。
珍珠一见到朱昌，不由都泪流满面，原来朱昌正是她当日飞马相救的那个青年男子。朱昌认出她后，激动得一把握住她的双手，却发现她的手异常冰凉，连忙捧在手心里给她呵了一口热气。不料他这一呵气，珍珠忽然倒在他的怀里，再一看，她竟然消失不见了。众人大惊，连忙大声呼唤着珍珠的名字，四下寻找。
就在这时，忽有一匹受惊的马从人群中狂奔而至，来到朱昌面前停下。朱昌定晴一看，这正是那天和珍珠共骑的那匹马，而马背上赫然驮着昏迷不醒的珍珠，她的背上还有一支断箭，伤口的血迹都已变黑了。这是怎么回事？珍珠刚才明明还好好的站在这里呀？
顾不上多想，朱昌赶忙上前将珍珠抱下了马，并请来郎中给她治病，然而所有的郎中都束手无策，说她受伤太久，错过了治疗时间，已无药可救了。朱昌这才知道珍珠在当日为救自己，被箭伤了要害，但她又记挂镇里的未婚夫和百姓们，故而魂魄离开了她的身体，来此地给人治病。
镇上的百姓听说了珍珠的事迹，无不痛哭流涕，就在这惊天动地的哭声中，珍珠最终离开了人世。此刻，朱昌的眼里满是悔恨的泪，其实珍珠一直不知道，他从前是个荒唐的人，整日就知道迷恋戏曲，常常和一些纨绔子弟为了当红戏子争风吃醋，这才惹来抄家的大祸。是珍珠的哥哥不忍心让妹妹难过，这才编了个谎言骗她，没想到她竟如此痴情！
自打珍珠死后，那朱昌从此痛改前非，将珍珠的故事编成了戏文，让她的故事一代一代流传下去……
