为了继续前进，我把一切交给时代和命运，并在自己的航途中经受一切考验——查理·达尔文。
连续几天的恶劣天气过后，“贝格尔”号又往西行，向合恩角驶去。
1833年1月11日，“贝格尔”号到达约克·明斯特尔山附近。就在即将靠岸的时候，大风暴又来了。“贝格尔”号又退回了海上，因为怕被岸边的激浪打沉。第二天，风暴不禁没停，反而更加猛烈，13日还是这样。在考察日记中，达尔文这样写道：
下暴雨的时候，在“贝格尔”号上除了天空中无数飞溅的水珠，什么都看不见。大海露出了恐怖的一面：巨浪无情地翻腾着，卷起极高的浪花，浪头把舰艇冲击的精疲力竭。令人惊奇的是，海面上，有一只信天翁展开双翼，顺着风平稳地飞翔在海面上。中午时分，一个巨浪打到“贝格尔”号上。因为受到浪击，“贝格尔”号颤抖起来，有一小段时间甚至分不清谁是谁，全舰上的人都处于慌乱中；这只船不一会儿又恢复了正常，继续向目标前进。
如果那个巨浪之后，再来一个巨浪的话，那么我们就会葬身鱼腹，彻底被解决了……
最后，“贝格尔”号又绕过合恩角。因为天气的原因，菲茨·罗伊舰长不得不放弃这个尝试——绕着火地岛向美洲西岸驶行。
同马太传教士一起，那三个火地岛人被带回故乡，分别是：琴米·白登，在达尔文害晕船病时，这个快乐而敏感的男人总是怜悯达尔文；约克·明斯特尔，身材矮小、性情忧郁、暴躁，但他看起来很健壮结实的一个男人；菲吉·巴斯凯特，她很朴素，看上去年轻，实际上却很沉着的女青年。
“贝格尔”号连遭风雨打击，这三个火地岛人说话了，他们的意见是：能不能先停泊在的琴米·白登的出生地朋松布海峡，不一定非要在约克·明斯特尔山附近登陆。马太传教士为了自己的同胞们，也打算同他们一起留下。
为了到达朋松布海峡，菲茨·罗伊决定进行一次探险，他上次航行时发现一条河——贝格尔河。他打算乘坐三只捕鲸船和一只舢板渡过这条河。贝格尔河周围，高达千米的群山连绵不绝，山峰陡峭，阴森森的密林覆盖着群山，一直到半山腰上。探险是以一些小港湾作为落脚点，沿着贝格尔河进行的。这次探险，参加的共有二十八人。
在伏里阿港口附近的土著人，一共大约有一百二十名。那三个火地岛人和传教士决定住在这里。舰上的人一起动手，把他们的家具用品搬上岸，并为他们盖起了三座大棚屋。他们开始在此地住下来。
菲茨·罗伊把舰上的人分成两批，一批留守“贝格尔”号，另一批跟随自己和达尔文去考察贝格尔河西段。
在一个大海湾的岸边，天黑下来的时候，菲茨·罗伊和达尔文所在的那批人支起帐篷，岸边到处都是松散的卵石，身体躺在上面，就像躺在软床上一样，松软舒适。睡觉的时候，达尔文在值班，他值上半夜，一直到凌晨一点钟才能休息。在这样的夜晚、这样的地方，他听着酣睡的水手们发出的鼾声和偶尔传来的夜禽鸣叫声，明显意识到生命的某种庄严。偶然传来的狗吠声，打破了黑夜的寂静，也把他从对生命的思考中拉了回来，他才想起这是野人居住的地方。
地形在探险队进入北边支流时开始变得更加壮观，高达两千米左右的群山，耸立在支流北岸。菲茨·罗伊为了纪念自己的这位旅伴，把其中的一座山叫“达尔文山”。达尔文兴致勃勃地看着这里优美的景色：溪流里的水，汹涌地流向下面狭窄的河道里，再穿过森林流向别处；一些碧绿色的美丽冰川，从山坡上一直通到水面；皑皑白雪覆盖着山峰。
达尔文正看得出神，突然听到菲茨·罗伊大叫道：“快去看住小船！”话音未落，达尔文便看到一大块冰由冰川上向河里砸落，瞬息之间，大冰块已砸进河里，激起了冲天的巨浪，卷走了那几只小船。达尔文和水手们立刻行动起来，马上狂奔向那几只小船，其中有一个水手被这滚滚的巨浪冲倒。滔天巨浪将小船高高抛起，所幸的是，浪头过后，小船还安然无恙。要是小船被卷走，情况就危险了，因为他们还要乘小船与“贝格尔”号会合，而且武器和食品也都留在这几只小船上。沿着南边的支流，探险队又返回到伏里阿港。
那三个火地岛人和传教士虽然在这里住了下来，但他们所处的境况并不好。达尔文不仅怀疑起来，把火地岛人运到英国，还让他们接受了先进文明，但他们回到故乡之后，境况并没什么大的改观。
早在1832年11月，汉斯罗寄给达尔文一本书——赖尔的《地质学原理》第二卷，那时候达尔文还在蒙得维的亚。在火地岛期间，因为恶劣的天气，不能出去考察，达尔文不得不躺在船舱里的吊床上阅读这卷书。
对达尔文来说，阅读这卷书具有特殊的意义。
先来看看赖尔《地质学原理》第二卷的主要内容。从第一章起，本书就分析了物种问题，赖尔在各章里都不同程度地研究了这个问题。物种问题是后来达尔文研究的基本课题，所以，这本书对达尔文的影响是巨大的。
不光如此，本书的其他内容对达尔文也有影响。书中探究了物种间的杂交，物种变异性的程度，物种的遗传性是否受外部条件的影响，叙述了拉马克的进化论，并对它进行了批判，最后，阐述了他自己对新物种产生和旧物种消失的看法。
赖尔在他的书中客观地阐述了拉马克的学说，赖尔不仅承认拉马克的一些观点是正确的，而且为了说明这一论点，他还用一些家畜和栽培出来的植物作实验。但拉马克学说的许多观点都没有确凿的证据，这一点令赖尔很恼火，以至于赖尔对拉马克很是不屑。赖尔本人同意不同意拉马克关于物种起源的观点呢？在这本书中，赖尔提到拉马克的这样一些观点：“一些物种蜕变为另外一些物种。”“猩猩能变成人。”很显然，他当时没有接受这些观点。赖尔认为，物种起源是最难以解开的谜，这一问题是秘密中的秘密。赖尔曾正确地指出造成旧物种绝灭及消失的原因，但关于新物种是怎么出现的，他就进退两难了，一方面对拉马克的理论表示同意，但又不相信里面的关于物种起源的观点；另一方面，他认为物种起源是大自然界中最神秘的事，是不可捉摸的。
在本书中，通过分析物种的变异性，赖尔得出的结论：在一定范围内，在外部条件的影响下，物种会发生变化；这些变异性的范围包括各种物种，但各物种所发生变化的程度也不相同；动物变异具有极端的偶然性，最常见于家畜方面，还因为人为的干预才出现的。他认为，不管外部条件发生什么变化，物种的变异都无法逾越某些界限。他还认为，即使借助于人的帮助，异种互相杂交，也无法产生出经久不变的种族，也不会产生出繁殖力强的后代。
在旅行途中，达尔文阅读了这本《地质学原理》第二卷。这卷书向他广泛展示出物种起源的理论问题。现代物种的形态与已绝种的物种形态之间的关系，变化的遗传性，生存的斗争，物种变异性的界限，相近物种彼此之间的关系，物种和变种之间差别的实质，家养形态和野生形态变化的大小等，这些问题，都由赖尔提了出来。但对书中的观点，达尔文是不是全部相信呢？应该不会，因为达尔文在收集各种各样的物种时，就对赖尔的观点不止一次地产生过怀疑。在收集时，达尔文发现，每一物种的变异都有一定的限度。这卷书对于达尔文及其思想的发展有着至关重要的作用，自此以后，达尔文的注意力和思考内容都用在了弄清物种起源的问题上。
2月26日，“贝格尔”号冒着大风向福克兰群岛驶去，到了路易港。菲茨·罗伊和达尔文惊异地发现，为了不让从布宜诺斯艾利斯来的其他国家的殖民者占领这些岛屿，英国已经抢先占领了它们。从前这些岛屿无人居住，但最近，法国人、西班牙人和英国人，都在觊觎这些岛屿。现在，英国的旗帜飘扬在岛屿的上空。岛上只住着二十几个人：一名英国人、二十名西班牙人，一名西班牙女人和两名女黑人。
1月12～13日，飓风在这里刮了起来，一艘停泊在这里的法国捕鲸船葬身大海。有几个法国人很幸运，抢救出捕鲸船里的储备食品，乘着舢船逃了出来。几名逃出来的法国军官，被菲茨·罗伊舰长接收，到了“贝格尔”号上。
这个岛屿长期被硬草覆盖着，显得阴森森的。达尔文在这里走遍了全岛。岛上只有海岸上有一些动物，根本没有树。他在海岸上观察到一种叫白色海牛的动物，它们一次能产很多卵，大概六十万粒。虽然产卵很多，但能长大的海牛却不多。
停泊在福克兰群岛期间，达尔文收集的动物并不多，因为这里的动物本来就不多，他只好进行地质勘测，或寻找一些贝化石。
暴风雨把一艘英国纵帆船抛到岸上，一艘法国考察船为了避免遭到同样的命运，下了四个锚。“贝格尔”号上也损失了不少索具和船帆，暴风雨还把“贝格尔”号的一只小船刮了下来。
此时，“海豹捕猎者”也到了这里，这艘船只主要做贩卖奴隶、捕猎海豹、在海上劫掠其他船只。1月13日，在火地岛海岸，从“贝格尔”号出来的一艘小船被暴风雨打碎，“海豹捕猎者”救了那艘小船上的全体船员，这次还把他们带来了。“海豹捕猎者”的船长叫洛乌，长得很像海盗，菲茨·罗伊从他那里买了一只纵帆船，是为了进行测量用的。4月4日，买来的这只纵帆船，被派往里奥内格罗，为了测量，那里还留有一些小船。
一天后，“贝格尔”号也驶向那里。
