正是在文学作品中，哥白尼看到了不同于当时公开宣扬而被普遍信奉的、以托勒密学说为基础的天文学观点。
不止一位古典作家以文学形式隐晦地提出，太阳是行星体系的中心，其他所有行星，其中包括地球，都围绕太阳旋转。
亚里士多德在自己的书信中也提到另外一篇论文，这篇论文综合地阐述了有关天体运动的知识。尽管哥白尼对托勒密的著作十分尊重，但还是发现其中存在矛盾，尤其是地球中心说更是漏洞百出。这种理论未能使哥白尼信服。
沃伊切赫教授的启迪，使哥白尼加深了这种疑惑。他阅读的古典作品中提出，对行星的运动还可以有不同于托勒密学说的其他解释。
为了解开萦绕在心头的这个谜，哥白尼更加广泛地阅读古典作品，遇到不明白的地方他也积极地和沃伊切赫导师做讨论。他相信，托勒密的学说不一定就是完全正确，一定还会有一个更加明确的学说存在。
一天，哥白尼兴冲冲地拿着一张托勒密的星象图来找沃伊切赫，一进门就兴奋地喊道：
“老师，我发现了，我发现了。”
沃伊切赫看到哥白尼这么兴奋，他倒了一杯水给哥白尼，说道：
“坐下来，慢慢说，发现什么了？”
哥白尼顾不得喝水，坐在沃伊切赫教授身边，说道：
“托勒密认为地球是静止不动的，理由主要有四条。第一条是希腊神话。据说巨神阿特拉斯在反抗主神宙斯失败之后，受到惩罚，站在世界西方的尽头上，用肩膀托住了地轴，用脚稳住了地心，用头和双手撑住了天空，所以地球就不动了。”
“嗯！你说的这个依据我知道。喝杯水，继续说。”
沃伊切赫将水杯送到哥白尼面前，让他歇口气继续说。
哥白尼端起水杯，一口气就将它全部喝干了，然后继续说道：
“它的第二条理由是以物理学为根据的。据说阿拉伯穆罕默德的灵柩在墓室里凌空悬着，四不沾边，什么支撑的东西都没有。这就说明地球是静止不动的，否则的话，灵柩就不能够维持原位了。”
“第三点其实是从第二点延伸出来的，是说如果地球转动的话，那么不仅灵柩不能保持原位，就连地上的石头也会抛起来，天上飞的鸟儿和云彩就会被抛到运转着的地球的西边去。”
“最后一个理由，如果地球是转动的，那么海水就会泛滥成灾，淹没整个地球。”
沃伊切赫教授听完哥白尼的叙说之后，紧接着追问了一句：
“你觉得这些说法能够站得住脚跟吗？”
“依我看，这些说法没有一个站得住脚跟。”
听了哥白尼的话，沃伊切赫教授长长地呼了一口气。
他继续追问道：“你的理由是什么？”
“这些说法，表面上看是说得头头是道，好像真像那么一回事，实际上完全牛唇不对马嘴，胡扯一气。”
哥白尼像是发现了某种真理一般，义正词严地说道：
“第一条，他说是巨神托着天空，可是谁都知道上帝都是宗教信仰，巨神原本就是一个虚构的神话人物，又怎么会存在世间？”
“第二条理由，穆罕默德的灵柩悬浮在空中，看似没有任何的作用力，听起来像是那么一回事，但实际上它是因为灵柩用磁石牢牢吸住。不管地球是运动还是静止，对于被磁石吸住的灵柩来说，根本没有任何影响。”
至于第三条，石头落地，鸟儿高飞，看起来像是符合人们的生活习惯和眼见学识，但仔细一研究，根本不是那么一回事。地球如果是在做匀速圆周运动的话，那么地球表面的水和空气也都是随着地球的运动而一起运动。
打个比方说，一块石头落地，在石头落地的过程中实际上它做了两种运动，一种是自上而下的自由落体运动，另一种是自西向东的水平运动。因为后一种运动是与地球的转动一起完成的，所以人类的肉眼看不到，我们仅仅能看到石头从上而下的运动。也就是说，哪怕地球是运动的，鸟儿、云彩也不会被抛到地球的西边去。
“最后一点和第三点其实是一样的。地球在运动的时候，海水也在跟随着地球一起做运动，又怎么会泛滥成灾，淹没地球呢？”
听完哥白尼的辩证，沃伊切赫欣慰地笑了，自己的这个得意门生还真是让他感到意外，这么隐秘的问题竟然被他一一解答了出来。他笑道：
“哥白尼，你真是一个善于发现真理的孩子。这已经是你的全部发现了吗？”
“不！还有一个，就是天空运动的轨迹。”
哥白尼从怀中把托勒密的星象图拿了出来，星象图上画满了大大小小的圆圈，代表着宇宙中一个个闪烁的星星。
“这不是托勒密的星象图吗？”沃伊切赫惊讶地说道。
托勒密差不多是天文学的老祖宗了。早在一千三百多年前，他把前人观测天象的资料汇集了起来，做了系统的整理，提出了“地心说”的天体系统，还绘制了一张天体运动的星象图。
星象图的中央是一个小小的圆圈，它表示地球。在托勒密看来，地球是整个运行圈内静止不动的中心。
地球的四周有七道逐渐扩大的圆圈，代表着天体运动的轨迹。距离地球最近的是月球，然后是水星和金星，接下来便是金色的太阳，最后是火星、木星和土星。
所有的星体在地图上都只是一个小不点，只有太阳是个例外，被浓墨重彩地扩大了好几倍，还涂上了火红色的标记，以显示太阳的威势。
从星象图上看，地球只是一个小不点，而太阳却是一个大圆盘，可正是地球这个小不点，竟然能够让太阳和其他行星都围绕着它做运动！
哥白尼指着星象图，激动地说道：
“我觉得这张星象图并不正确。像地球这样的小不点，凭什么能够让一连串的行星围绕着它运动，甚至还拉上威风凛凛的太阳？我觉得这不是不可思议，简直就是愚不可及！”
“那么，按照你的说法，应该是什么样子的呢？”
“要是依我的说法，托勒密敢让地球静止不动，我也敢说地球绕着太阳转！”哥白尼斩钉截铁地说道。
房间一下子安静了下来。哥白尼和沃伊切赫两人，谁都没有开口，反倒是窗外的鸟儿叫得更欢快了。
哥白尼敢于说出这句话，需要多么巨大的勇气呀！
在黑暗的中世纪，托勒密的地心说是教会支持的学说，反驳地心说，就是和教会作对！和教会作对，在整个欧洲都没有生存的空间呀！
要知道，在那个政教合一的年代，教会属于统治力量，整个欧洲都属于罗马教皇统治的范围，不管是国王还是贵族，都必须听从于教皇的意志。
和教会作对，可以说毫无生存的可能！可是，即便如此，哥白尼这个20岁的年轻人，还是勇敢地站了出来，提出了这个惊世骇俗的观点。
“好！好！好！一千三百多年前的托勒密遇到对手了呀！”
沃伊切赫先是沉默了一下，然后连声叫好，赞扬了哥白尼。
沃伊切赫严肃地说道：
“哥白尼，你是勇敢的孩子，放手去追寻真相吧！用你的勇气，打破禁锢！去解放太阳吧！”
哥白尼原来以为可以和沃伊切赫教授一起寻找天体运动的真相，但是可惜，意外总是不期而至。就在这个时候，沃伊切赫教授却要离开克拉科夫大学。
沃伊切赫教授对于哥白尼的成长也感到很开心，他隐隐地感觉到了未来的天文学将会爆发一场惊天动地的革命，而引爆这种革命的极有可能就是自己这个热衷天文学的学生。
夜晚，繁星闪烁，无边无际的苍穹以它神秘的魅力强烈地吸引着哥白尼，他年轻的心为它跳动，他火热的血为它奔流。
沃伊切赫教授又一次和哥白尼漫步在草坪上，沃伊切赫教授沉默了一会儿，然后说道：
“哥白尼，我今天见到卡利玛和了。他问起了你的学习情况，我都告诉他了。”
听沃伊切赫教授提起卡利玛和，哥白尼的脸上闪过一丝暖色，他说道：
“好久没有见到卡利玛和叔叔了，不知道他最近好不好。”
沃伊切赫教授呵呵笑道：
“你这个小滑头，只怕你看起书来，什么事情都放到一边了。今天找你来，是有一件事情要告诉你，我即将离开克拉科夫大学了。”
哥白尼听到这个惊人的消息，愣住了，呆呆地问道：
“导师，为什么要离开？你在这里不是很好吗？”
沃伊切赫教授抬头看天，叹道：
“是呀！这里真的很好，我也舍不得离开。”
“那就不要走啊！到底是什么原因让您这么突然想要离开呢？”哥白尼疑惑地问道。
“卡利玛和教授告诉我，国王胞弟弗里德里克·雅盖隆奇克红衣主教大人要我离开现在的教学岗位，去立陶宛出任亚历山大的私人顾问和大公国宫廷秘书。我已经答应了这项任命，公文大概这两天也就会下来。”
亚历山大是立陶宛大公、波兰国王的兄弟和未来波兰王位继承人。沃伊切赫教授去担任他的私人顾问和大公国宫廷秘书，该是一项多么重大的使命呀！
难怪老师无法拒绝！同时哥白尼也觉得这个职位很适合沃伊切赫教授，在那里，他渊博的知识还能够得到更加淋漓尽致的发挥！
只是，导师走了的话，谁来教导自己呢？新的导师还能够像沃伊切赫教授这样敢于打破教会的思想禁锢吗？如果不能的话，自己又应该怎么办呢？
想到这里，哥白尼的心中没来由地闪过一丝从未有过的慌乱。
其实沃伊切赫心中也放心不下哥白尼，他劝慰道：
“哥白尼，我离开之后，对于天文学的研究工作就都交给你了。不管别人说什么，你都一定要坚持自己的想法，一定要相信自己的眼睛。”
“老师，我知道的。”哥白尼沉重地说道。
送别恩师的那一天，哥白尼的心情像灌了铅似的沉甸甸的。他挽留不住老师，可是，他又多么想挽留他呀！
看着哥白尼沮丧的神情，沃伊切赫教授哈哈一笑，说道：
“又不是去送葬，你哭丧着脸干什么？小伙子，高兴点，看看这是什么？”
哥白尼抬头一看，原来是一本天文学方面的书籍。
“好好干吧！揭开真理的希望就寄托在你身上了！”
沃伊切赫教授重重地拍了拍哥白尼的肩膀，鼓励他勇敢地向天文学的顶峰攀登。
望着手中珍贵的临别赠品，哥白尼的心里更像是倒了五味瓶，酸甜苦辣不是滋味，一股伤感的离情充满心胸。
哥白尼，一个堂堂男子汉，不禁背过脸去，抹去眷恋的泪水，紧紧地握住老师的手不放。他说：
“您不是请了一年的假吗，到时可一定要回来呀！一定要回来呀！”
他说这话时心中似乎有一种不祥的预感。
果不其然，沃伊切赫教授走了一年后，就传来了他逝世的噩耗，让哥白尼悲痛欲绝。痛失良师，让哥白尼不得不独自一人扛起研究天文学真相的重担。
