下午五时大殓，有吴佩孚的亲属好友参加。棺是金丝老楠木原料，板约有尺厚，紫色，系华北第一大棺，是万益祥木厂出品，原价一万一千元。木厂老板说：“我一生仰慕吴大帅有关、岳之风，此大棺只收七千五百元工本费，以表钦佩之意。”当大殓时先将棺木停放堂内正中，将遗体放棺中，遗体遵吴佩孚遗嘱，着道装蓝道袍，沿金边青大沿道帽，上盖红色经帔，有“西方导引”四字。遵遗嘱，殉殓之物仅放一生所得的勋章，及入道教会中所得的纪念章，并放包金制钱八枚。最后，家属亲友与吴佩孚遗体告别。张佩兰放声痛哭，子女等纷纷呼唤，声音绝惨，吴佩孚的部下和多年的子弟兵及下属亲友等，皆泪下不止。
灵前的供桌上，供着吴佩孚的遗像，前边陈列着用茉莉花及松枝编成的“西方正路”四个字；另外有鲜果等供品。6日送三，5时许，家祭后在僧道引磐声中，出发送三。列队而行的有清音乐鼓乐、警察局乐队、雍和宫喇嘛、东岳庙道士、拈花寺僧人、白云观道士、岫云寺禅僧。继后是各方代表二千余人，吴佩孚旧日僚属均穿孝服白冠，随众而行。再后为尼僧及乐队，最后是孝子及女宾。路线出什锦花园胡同东口、沿东四北大街南，至神路街口，沿途有警察、宪兵随行护卫，送至拈花寺。
上海《申报》发表社评题为《悼吴佩孚将军》。社评写道：“读圣贤之书，治军旅之学：生逢乱世亦尝叱宅风云，身陷重围则能砥砺节操；以孤臣孽子之资，在路末途穷之日，而富贵不能淫，威武不能屈；群魔侵寻而独秉正气，奸邪交逼而忠贞自持；此史乘所罕见，亦当代无其俦，是可以昭垂百世，彪柄千古，吴子玉将军诚死而永不死者也。平津沦陷，吴将军在平，杜门谢客，日人谋致为己用，吴将军却之；当时日人气盛而欲奢，以为囊括神州，易如反掌，不得吴将军，尽得降将军，遂置之。其后，日人知军事侵略不足以竟全功，乃多方罗致鹰犬，俾为爪牙；尤愿得威仪声望素着者，甘为傀儡，代为号召。彼知吴将军之历史，而不知中国之历史；彼知吴将军之威仪声望，而不知吴将军固孕育于中国五千年文化之下，固中国文化传统之典型人物也。遂以吴将军为合选；甘言厚币之无效，威胁之，威胁之无效，敬礼有加，诐辞杂陈：许之以练兵，奉之以专权，吁之以‘救民救国，救吾东亚’，吴将军辄笑却之，尝坦然答日方某说客曰：‘先撤兵，中国的事交给蒋介石……’……吴将军于二日前，即民国二十八年十二月四日……在北平逝世，实为中外所极震悼。我人诚不知国民政府将何以表扬之，中国人土将何以纪念之。”
吴佩孚去世，重庆国民政府各军政首脑纷纷发出唁电。
国民政府主席蒋中正：
北平吴子玉先生家属礼鉴：顷闻子玉先生因患牙疾，竟致不起，噩耗传来，殊深怆悼。溯自寇患恁陵，于兹八载。先生托志春秋，精忠许国，比岁以还，处境弥艰，劲节弥厉，虽暴敌肆其诱胁，群奸竭其簧鼓，迄复屹立如山，不移不屈。大义炳耀，海宇钦崇，先生之身虽逝，而其坚贞之气实足作励兆民，流芳万古。除请政府优颁饰终令典，以彰明德外，务请善体遗志，节哀顺变，藉襄大事，至所企盼，中正鱼。
行政院长孔祥熙：
北平吴子玉先生家属礼鉴：子玉先生，英风劲节，薄海同钦，噩耗惊传，怆怀实切，特此电唁，尚望节哀，孔祥熙鱼院总申。
监察院长于右任：
北平吴子玉将军家属礼鉴：子玉先生临大节而不可夺，虽百世称矣。兹闻偶撄微疾，遽归道山，噩耗传来，惊悼殊深。特电致唁。并希节哀。于右任鱼。
外交部长王宠惠：
北平吴子玉先生家属礼鉴：子王先生身际艰虞，克完大节，不挠不屈，民族楷模。顷闻偶染微疴，遽辞尘浊，燕云北望，感怆弥深，谨致唁词，敬析节哀顺变为祷。王宠惠。
军政部长何应钦：
北平吴子玉先生家属礼鉴：闻子玉先生昨夜仙逝，何胜惊悼，子玉先生，陷身敌区，而大节凛然，数年如一日，洵足为我国军人楷模，乃偶以微疾，遽归道山，噩耗传来，倍增凄怆，尚望夫人顺变节哀，妥营丧葬，特电驰唁，并候礼祺。何应钦微。
中国国防最高委员会秘书长张群：
北平吴子玉先生家属礼鉴：子玉先生宏猷硕望，惊传溘逝，遐迩痛惜，尚祈体承遗志，勉襄大事为荷，谨电布唁。张群鱼。
孙科：
北平吴子玉先生家属礼鉴：国难方殷，将星遽陨，远传噩耗，怆悼同情，诸祈节哀顺变，勉襄大事而慰英灵，是为盼祷。
孙科阳印
教育部长陈立夫：
北平吴子玉先生家属礼鉴：子玉先生高风峻节，百世可师，虽处艰虞，四海同悲，北望燕云，敬致吊唁。陈立夫叩阳。
第27集团军总司令杨森，在军中惊悉吴子玉将军在平逝世，甚怆惋，除汇赙仪金五千元外，并电其家属致唁。
1939年12月28日，山东旅陕同乡会，以已故上将吴佩孚大节凛然，遐尔钦仰，噩耗传来，同深悲悼，特于28日下午四时举行公祭，到会各界代表及同乡千余人。蒋介石送挽联曰：“三呼渡河，宗泽壮心原未已，一歌见志，文山正气自常存。”程潜派晏勋甫、沈鸿烈派李况松代表致祭，同乡方面由彭昭贤、丁履进等领导公祭。
1940年1月21日，国民党及国民政府及民众团体为吴佩孚举行追悼大会，追悼会在重庆银行公会大礼堂举行。蒋介石、丁惟汾、于右任、孔祥熙、叶楚伧、朱家骅、何应钦、陈立夫、洪友兰、吴稚晖、邵力子及各机关团体代表二百余人出席。会场四壁遍悬各机关团体及友好所赠的挽联，吴佩孚遗像前更是满置各长官所送的花圈。追悼大会由国民党中央常委丁惟汾主持，领导行礼并送花圈，宣读中国国民党执监委员会公祭文：
维中华民国二十九年一月廿一日，中国国民党中央执行监察委员会。敬以香花黍醴致祭于吴子玉先生之灵日：呜呼，东鲁之英，纪耽儒术，壮起治兵，南塘束伍，赫赫令名，志存尊攘，为国干城，淡泊辞荣，艾年释甲，诗书自娱，禽鱼相狎，谢传围綦，忠爱天成，流风斯洽，临廉关岳，熟习春秋，大防必谨，正义是求，敌国外患，一忾同仇，时出高论，每抒远猷，抗战以还，劲节弥着，虽有蜉蝣，曷撼大树，实望田文，说于秦锢，不吊昊天，溘先朝露，良图永息，道路所悲，惟兹正气，百世可师，侵地待复，魂魄焉依，寄哀遥奠，缅想英姿，尚飨。
蒋介石祭文：
维中华民国二十九年一月廿一日，中国国民党总裁蒋中正，敬以香花清酌致祭于子玉先生之灵曰：呜呼，陶林风邈，曾在土乾，五十余载，恬嬉偷安，韬钤寡讲，戎政孰娴，将才将德，兼具尤难，翳维先生，远慕关岳，砥砺廉隅，持躬慎悫，部勒谨严，临淮最卓，微言大义，夙昔钻研，出处之际，审择靡愆，为民为国，荣利可蠲，舆人讴诵，夫岂偶然，子瑜神交，春明倾盖，欢若平生，轻裘缓带，其气冲宵，其言正大，谓兹砥柱，中流攸赖，姜桂之性，老而弥芳，身处危境，心系中央，无屈威武，屡斥鸱张，苦心支持，艰险备尝，国步未平，方资雄略，胡不然遗，停云遥落，陈迹难寻，清言如昨，还我山河，九京可作，尚飨。
孔祥熙祭文：
呜呼！人能宏道，非道宏人，沉沦末劫，孰登其真，卫道崇儒，和人倡万，不有疾风，劲节奚见，赫赫吴公，允武允文，嘘气塞天，上薄浮云，手握韬钤，取威定霸，虎视中原，喑鸣叱咤，役驱风雨，嗡虚雷霆，玄女之诀，握奇之经，孙吴穰苴，以逮壮缪，说礼敦诗，是式是鹄，糅综诸教，贤圣佛山，世则易效，寞漠者天，天不可知，惟数可识，着龟十筮，各者厥职，出天入人，以释春秋，服杜却步，藐焉绝俦，酒酣弄笔，龙虎卧跳，黄河高吟，掷笔大笑，我之识君，共和初年，横议蜂起，倒乾翻坤，世变日嗟，颓流莫塞，非张圣教，国将不国，声气应求，俊彦偕来，以督以董，伟哉瑰才，威毅之容，刚方之气，执手笑言，岸然伟异，深膑孤嗟，孰振衰微，干城吾道，君其庶几，君顾寰宇，多否少可，先圣胃胤，不鄙谓我，而燕而洛，合会不常，君之威名，荡震八方，海波沸腾，岛夷跋浪，蠢兹鲸鲵，乘潮而上，横吞狂噬，毒痛黄图，吁我族姓，万骨其枯，皇皇幽都，寇仇窟宅，嘘毒潜吹，万怪皇惑，公老北居，欲劫其名，以为徽帜，以收豪英，譬说百端，惟利之诱，君日圣学，义不污垢，兵卫盛陈，以威迫之，公曰立节，甘死若饴，支柱万艰，郁蟠孤愤，夷夏严防，麟径之蕴，朔南间阂，讹方朋兴，我独谓君，秉节犹恒，折此群凶，恃其正义，挥斤有余，告我无虑，寄书遣我，墨沈犹新，奈何微疾，贼我天民，精爽式恁，道教来坠，所学平生，允矣无愧，为天下恸，兼哭其私，九天莽荡，灵其安之，尚飨。
吴佩孚生前友好送挽联、挽诗、词甚多，选录几联：
杨圻：
本色是书生，未见太平难瞑目；
大名垂宇宙，长留正气在人间。
曾琦：
晚节喜能全，忆当年横槊赋诗，直欲戎衣成霜业；
诤言曾见纳，痛此日盖棺定论，犹恁正气表孤忠。
刘泗英：
志在春秋，隐公以还悲绝笔；
心存揖让，秦伯而后惜斯人。
吴佩孚死后，日本东京大学一位教授赴北平亲自吊唁。他抵达北平时吴佩孚的丧事已过，便将挽联亲交张佩兰，其词日：“败师不入外租界；正谊羞登傀儡场。”公正、含蓄刻画了吴佩孚晚年的言行。
直到1945年“8？15”抗战胜利后，国民政府认为：“故吴上将军佩孚，于沦陷期间，忠贞不屈，大节凛然，为国殒殁。为表彰忠烈，追赠陆军一级上将衔”，并以“故旧袍泽”和“平市各界”的名义发起公葬。1945年12月9日后，以国民政府行政院副院长孔祥熙、军事委员会北平行营主任李宗仁为首组成“蓬莱吴上将军营葬委员会”，并在《华北日报》、《世界日报》、《北平时报》、《北平新报》等均刊出启事：订于12月15日下午1时至3时在拈花寺公祭，16日安葬于玉泉山西麓。
11日，蒋介石偕夫人宋美龄乘飞机抵达北平，孔祥熙、李宗仁及北平市长何思源等到机场迎接。孔祥熙、李宗仁等在怀仁堂向蒋介石报告了对吴佩孚公葬的安排。蒋介石点头同意，当即拿起粗红铅笔批示：营葬经费法币5000万元。蒋介石又向何思源说：“何市长，你代我恭读祭文！”
贵州省主席杨森知道公葬吴佩孚的日程安排后，特乘飞机赶到北平，参加他的老上司吴佩孚的葬礼。
12月15日这天正是星期日，到拈花寺参加公祭的人很多。拈花寺的东院是停放吴佩孚灵柩的地方。拈花寺门口照例摆了大鼓锣架，还有穿一色新军装的士兵在门口站岗。等来祭者的汽车在门口一停，营葬委员会的礼宾人员立即将来宾迎至礼宾处，送上一朵红黄两色的菊花，下边缀以黄色绸条。拈花寺二门以内，甬道两旁，竖着北平各界给吴佩孚送的大型锦旗、锦寺标、万民旗伞等及其花圈、挽联。
吴佩孚的灵柩放在北殿正中，因他生前信佛，所以灵柩上扣着一个黄色的棺罩，上面绣满了带有莲花座的佛字。大殿前搭了三门式的大型牌楼，正中挂着一块布制正楷字的大匾，上书“正气常存”，上款是“吴上将军千古”，下款是“蒋中正”。
下午1时后，北平行营主任李宗仁一行及吴佩孚的旧部、友好杨森等，均陆续莅临致祭。下午2时，何思源市长代表国民政府主席蒋介石来到灵堂，他首先恭敬地上香行礼，然后展读《蒋主席祭文》：
蓬莱古都，实生异人，蜚声中外，良非无因，溯公少时，肄业黉序，学剑学书，允文允武，四方多故，慨然澄清，请缨投笔，久典甲兵，归隐旧京，功成身退，书画怡情，遵时养晦，天祸中国，日寇侵凌，偶撄牙疾，遂殒大星，不为势屈，不为利诱，又节坚贞，询堪不朽，玉泉山侧，瘗公之灵，穹宫幽邃，万古长扃，尚飨。
16日，为吴佩孚公葬之期，上午10时许，从拈花寺起灵，灵柩抬经八道弯至武庙前，即在鼓楼西大街抬上载重汽车。灵柩上扎上了松柏枝的棺罩，正面悬挂着吴佩孚的遗像。另一辆挂着蒋介石的“正气常存”匾额和国民政府褒扬令。后面便是张佩兰、吴道时、营葬委员会成员及蒋介石代表、北平市长何思源等人的送葬车。车队，行经鼓楼、鼓楼东大街、交道口、王府井大街、东西长安街、西单、西四、新街口，出西直门，下午2时到达墓地——王泉山的西麓。下葬后，举行祭礼，由北平行营主任李宗仁主祭，何思源、吴铸人陪祭。李宗仁、吴铸人分别致词。2时半礼成。
一代枭雄吴佩孚，从一介书生秀才，弃文从武，横刀戎马数十载，身经百战，威震八方，达到辉煌极顶，又被跌入低谷深渊，历经人生沧桑辛酸；晚年清贫淡泊，失败不屈，保持中华民族的正气和骨气，在生命终结时划上闪光的亮点。功罪是非留与世人评说。
