稳住局势之后，袁世凯开始进行调查。经过调查发现，这次事件的主要原因是，德国人修建铁路时征用了高密百姓的田地，可是德国人的赔偿却没有达到百姓们的要求。看来，这是一个关于赔偿数额的讨价还价的事情。弄清原因之后，袁世凯便代表高密百姓开出了一些条件，与德国人进行谈判。
在这次谈判上，袁世凯显示出了自己强硬的作风。由于他掌握了充足的证据，德国人只好作了让步，对高密百姓追加了赔偿。不仅如此，袁世凯还抓住机会，对德国人在山东的修路、设立路矿公司、招工、征收厘税等事项，重新进行了规定。
就这样，一场眼看就要爆发的战争被袁世凯平息了下去，而且还一定程度上维护了中国的主权。一时间，袁世凯在山东声威大震！
“乌合之众”靠不住
袁世凯在山东的政绩是有目可睹的。然而，由于他对义和团采取了过于严厉的措施，因此遭到了报复。这是怎么一回事呢？
原来，义和团的骨干们为了报复袁世凯，便勾结清朝的一些官员，向朝廷告状。最终，袁世凯虽然没有受到直接危害，但是他的胞兄袁世敦却被革了职。
很显然，这是一招杀鸡给猴看，让袁世凯收敛一下。然而，性格强硬的袁世凯并不吃这一套，他顶住压力，向朝廷上了一封《遵旨筹议官练私团事不可行据实复陈折》，表明了自己的立场和态度。
在这份奏折里，袁世凯写道，经过自己的调查，所谓的义和团其实就是离卦教中的义和门，跟曾经想要推翻清朝统治的白莲教是一个性质的组织。因此，取缔义和团绝对不只是取缔了一个拳会那么简单，而是消除了威胁清朝统治的隐患。
当时有一些官员固执地认为可以依靠义和团来对付洋人。针对这种观点，袁世凯重申，义和团并没有真正的战斗力，是一帮乌合之众。他们不仅聚众闹事、乱杀洋人，而且还侵扰平民百姓，跟土匪没有什么两样。这样的一个组织，哪有什么力量来对付正规化的列强军队呢？
在奏折最后，袁世凯掷地有声地劝谏道，从古至今，都没有利用旁门左道来抵御外敌入侵的，因为他们根本就不会威胁政治稳定。正是由于此，朝廷依靠义和团来对付洋人的想法是不可行的。
然而，朝廷对于这些十分正确的进言，并没有予以采纳。正是由于这个 原因，虽然山东的义和团运动在袁世凯的有力打压之下已经不见了踪影，但 是在河北、天津等地，义和团组织却迅猛发展。
大家会好奇，朝廷为什么会不采纳袁世凯的建议，却对义和团运动既不镇压也不支持呢？其实，这是清政府的一种政治策略。当时，义和团组织在面对袁世凯的大力打压下，已经改变了最开始与清政府敌对的态度，打出了拥护清廷、驱逐洋人的口号。
对于打着如此口号的组织，清政府还是比较支持的。然而，朝廷也清 楚，义和团归根到底不是什么好的民间组织，对社会政治秩序破坏不小。于 是，在这两种考虑之下，朝廷干脆就对义和团运动采取了睁一只眼闭一只眼 的态度。
正是由于这个原因，原先准备和袁世凯一起打压义和团的直隶总督裕 禄，现在也不敢乱来了。于是，河北、天津一带的义和团组织才像雨后春笋 般越来越壮大。
可以说，当时北方的义和团运动已经到了无政府状况。义和团成员们四 处设坛招收门徒，捣毁教堂、杀死洋人，甚至拆毁铁路和通讯设施。按理 说，对于具有如此巨大破坏力的民间组织，清政府应该予以坚决取缔才是， 但是为什么义和团运动却得到了朝廷的纵容呢？
除了上面讲到的原因之外，还有一个重要的原因就是清朝统治者的迷信 思想。我们都知道，十九世纪末、二十世纪初，西方列强早已进入科学思维 的时代。而此时的中国，上至清政府的统治者，下至一般百姓，整个的思维 方式还是停留在中世纪的迷信之中。
在当时的中国人看来，神仙鬼怪的存在是毫无疑问的。只要具有某种法 术，便能搬请天兵天将下凡，或者使得自己刀枪不入，有如神助。正是在 这种思维方式下，清政府的统治者们才相信可以依靠义和团的成员们去打， 败洋人。
其实，慈禧等统治者的如意算盘打得很好，他们想先利用义和团打击列强，然后再与列强谈判，获取利益。正是由于清政府的纵容，义和团组织才迅速发展。很快，在河北和天津等地，凡是有洋人的地方，几乎每隔几天都会发生教案。
到了1900年的夏天，义和团组织开始进入了北京。据说，当时十多万头上缠着红、黑、黄等各色头巾，脚上绑着红色布条，手上系着白色咒符的义和团成员们来到了京城。
他们进城后，就像巡捕一样，四处捉拿洋人。不仅如此，他们还捉拿和杀害亲近洋人和洋教的中国人。
在他们口中，洋人就是“老毛子”和“大毛子”，是要赶尽杀绝的；“二毛子”则是信仰洋教的中国人，如果在规定时间内不退教，同样杀无赦。至于“三毛子”，则是崇洋媚外的中国人，包括买洋货的中国人在内，也要根据情节轻重予以惩罚。
大家或许会问，义和团成员要捉拿和杀害洋人倒是容易，毕竟洋人跟中国人区别很大，容易分辨。那么，他们又是怎样判断一个中国人是不是“二毛子”呢？
说起来好笑，义和团辨别一个人是不是“二毛子”的方法非常简单：他们会抓住一个嫌犯，让他跪在祭坛前，接着点燃一张写着义和团保护神名字的纸条。如果烧后的灰往上飞，那么这个人就不是“二毛子”，往下落就是。
如此荒唐的审判，居然在清政府的首都时不时的发生，真是一出闹剧！
闹剧同时也是悲剧！义和团大肆杀害洋人，很快就激怒了西方列强，战争最终不可避免地爆发了。这就是八国联军的侵华战争。
“辛丑"的悲剧
八国军队的统帅是英国海军中将西摩，他率领着英、德、俄、法、美、 日、意、奥的八国军队，几乎不费吹灰之力就攻下了大沽炮台。在那里，他 们等待着清政府的交代，扬言若答复让他们不满意，将会杀进京城。 这一下，清政府慌了手脚。急坏了的慈禧想到了李鸿章，她多次招李入 京，可是早已对外事心灰意冷的李鸿章，每次都以广东事务繁忙予以推脱。 就在这个节骨眼上，德国公使克林德却在前往总理衙门的路上，被八旗 军官恩海枪杀了。不仅如此，毫无政治头脑的义和团成员们又开始围攻各国 使馆。 局势变得不可收拾！慈禧心中明白，西方列强不会买这笔账了。于是， 这个年迈的女人像发了疯一样地向十一国(除了上述八国之外，还有西班 牙、比利时、荷兰)宣战！可以想象，这样的一场战争从一开始就注定了其 失败的结局！ 当时，真正有见识的清朝官员，比如两广总督李鸿章、两江总督刘坤一 和湖广总督张之洞等，几乎对保住中国的西面和北面持绝望态度。他们一致 认为，应该效法东晋和南宋，守住东南半壁江山，拒绝执行慈禧对外宣战的 诏令。这就是所谓的“东南互保”。那么，此时身在山东的袁世凯又是如何 应对时局的变动的呢？
很显然，袁世凯也认为清政府会在这场战争中失败。然而，他却采取了与李鸿章等人不同的策略，既不直接拒绝诏令，又不真正发兵迎敌，而是命 令军队原地踏步，对战事持观望态度。不过，在这场战争中，袁世凯还是起 到了积极的作用。比如，他担负起了通讯中转的重大责任。
当时，华北等地的交通和电讯遭到严重破坏，东南和全国各地的各种电 报、奏折无法直接上达朝廷。无奈之下，这些地方的官员就只好将电报和奏 折先发到袁世凯所在的济南，然后由袁世凯代为上奏。同样的，得到批复的 奏折和朝廷下达的命令也是先发到袁世凯处，接着由袁世凯转发各地督抚。
大家可以想象，在当时纷乱的战事中，袁世凯担负起通讯中转的职责， 该是多大的工作压力。不过，他依旧做得有条不紊，指挥若定！
在通讯中转之余，袁世凯还用心保护好西方列强的使馆和各国公使。他 明白，在这样的局面下，保护住一个外国人，就会对以后的谈判带来好处。 这才是一个高瞻远瞩的政治家所应具有的胸怀！
不到两个月时间，结局早已注定的这场战争就结束了。1900年8月14日， 八国联军攻占北京。至于清政府想要依靠的那十来万义和团“勇士们”，一 时间都人间蒸发了。
8月15日，慈禧太后打扮成一个乡下老太太，带着光绪皇帝，混在逃难的 人群中，离开了北京城。9月10日，慈禧太后一行人逃到了太原。早已暗中派 人跟踪慈禧的袁世凯，很快就给慈禧送来了二十五万两白银，以供花费。对 于落难的慈禧来说，这笔钱无疑是雪中送炭。年迈的慈禧看着这些钱，可谓 是大受感动，对袁世凯更是视为忠臣。
不久，慈禧又逃到了西安。在这个古旧的都城里，年迈的慈禧感到了前 所未有的耻辱。她痛定思痛，在发布了《罪己诏》之后，又于12月1日，也就 是自己生日那天，下诏宣布全面改革清朝政治。
两个月之后，慈禧以光绪皇帝的名义，正式宣布变法。在变法初期，她要求各省督抚在两个月之内上书各项改革方案，以备朝廷新政所用。
慈禧宣布变法，现在看来，很大程度上是因为她经历了这次劫难之后的痛定思痛。然而，对于当时的各省督抚来说，却是很难琢磨的。
在他们看来，慈禧对于变法的态度一向都是坚决反对的，以前的戊戌变法就是最好的例子。可是，现在她却突然宣布变法，实行新政，还要各省督抚畅所欲言，这确实让他们搞不明白。于是，很多省份的督抚都采取了观望态度。然而，慈禧这次可是真的。看各省督抚没有多大反应，她十分着急，便下诏成立了所谓的新政督办政务处。在这个机构里，囊括了清政府当时几乎所有的重臣，比如庆亲王奕匡、大学士李鸿章、荣禄、户部尚书鹿传霖、地方大员刘坤一、张之洞等。或许是由于慈禧发布诏令的地点是在偏僻的西安，因此地方上的反应依旧不强烈。当时，只有袁世凯在接到诏书的第四天，就上了一个《遵旨敬抒管见上备甄择折》，并提出了一系列的新政措施，涉及了政治、吏治、教育、外交、财政和军事六大方面。不仅如此，袁世凯还接着宣布，山东立即启动各项新政措施。实际上，就算慈禧不发布诏令，坐镇山东的袁世凯也想对山东进行各项改革了。尤其在教育制度方面，袁世凯可以说是花了大力气的。
1901年10月，袁世凯在山东济南创建了中国第一所省立大学，同时制订了中国第一份地方性的教育法规——山东学堂章程，采纳了很多西方的教育思想和教学内容。不仅如此，美国人赫士还被袁世凯聘来担任了总教习一职。袁世凯的这番举动，并不完全是他自己心血来潮。在一个月之前，清政府下令将全国各省的省城书院改成大学堂，各府和直隶的书院改为中学堂。因此，我们可以说，袁世凯在山东的教育改革是顺应时势的一个举动。由此，他也成为了近代中国教育制度改革的先驱人物。虽然以慈禧为首的清政府决意改革，但是之前和八国联军的账还得接着算。李鸿章全权代表清政府，与八国联军谈判和签订了《辛丑条约》。这又是一个丧权辱国的条约，仅仅是赔款一项，就有4亿5000万两。如果算上39年的利息，总共有9．8亿两。这可是清政府12年的财政收入！
签订完这个条约，李鸿章生了一场大病。此时的他，早已身心俱疲。到了第二年，也就是1901年的11月7目，李鸿章在悲愤交集中离开了人世。
