体力训练主要有两个特点，一是注重军官的体力锻炼；二是特别注重器械锻练。以往的北洋军队一般只注重兵士的体力锻炼，而较少注重军官，尤其是中、高级军官的体力锻炼。
而冯玉祥在练兵中，对初、中级军官的体力训练决不允许松懈。对于器械体操的训练，不是仅挑选一部分官兵进行专业练习，而且将其作为全军官兵必修的锻炼科目，规定每一个士兵及中级以下的军官，必须练会铁杠三套，即“屈伸上”、“摇动转回”、“侧立”。最低限度也要学会两套，即便是校级以上的军官，起码得会铁杠的“屈伸上”。“对于会三套的军官发给红色铜质证章，会两套的发给黄色铜质证章，兵士则佩戴红、黄色布质胸章，使人一看便知道谁会三套、谁会两套。除了这种鼓励于识别之中的办法外，还规定了在平日术科评比里面，列入铁杠一门，并且把会不会铁杠三套定为官兵升级考试科目之一。”张知行：《西北军练兵的一些特点》，《冯玉祥在陕西》，第123页。
射击教育方面着重三点：一是爱护武器，使官兵熟悉各自使用的兵器性能、特点和偏差，以便实弹射击的时候，能有效地命中目标。二是为了节约弹药，简单扼要的口号是“一粒子弹要消灭一个敌人”。三是在日常操练之中，规定每天每次收操之前，凡是步兵都要做“端枪架子”动作(即立射姿式)10至20分钟，以加强射击的臂力训练。由于强化了射击训练，尤其是军官的射击训练，使官兵的射击水平都有所提高。一次，苏联军事顾问观看冯玉祥操练，有些顾问自命不凡，以为自己是神枪手，提出进行实弹射击比赛，百步之内三发三中，而冯玉祥操起枪也是三中靶心，随行的卫队团长、参谋长等人也不甘示弱均三发三中，使苏联顾问们叹为观止。
臂力训练，以提高士兵展开短兵相接式战斗能力，在训练中着重三方面：其一，中国式的刺枪，即从中国武术里的花枪，选取刺、挑、拨、捉、撞各种动作，编成四套枪术，从个人以至班、排、连都使用这种刺枪术进行操练。其二是劈刀技术训练，即特制中国式的大刀，采用我国传统武术中的刀法，使士兵练习劈刀。这种大刀，寒光闪闪，在战场上很有威力，故冯玉祥颇为重视。因而在西安练兵时，劈刀训练便成为不可缺少的一课。在历次战斗中，冯玉祥部队的大刀队，光着赤膀，冲锋肉搏，那一种拼命决斗的精神很能在精神上“先声夺人”
，使敌丧胆。其三还吸收部分日式劈剌方法，由一些从日本士官学校毕业回国的留学生充当教官，先教给初级军官，再在连队教练。这种日式劈刺训练，也逐渐成为冯军中的一种特色项目。
夜战训练，采取如下步骤：新兵入营不久，就教他们夜间动作。先教夜间集合。在夜间听到哨音和号音后，每个士兵能把衣物装备按照就寝前摆好的次序，一件一件地穿好，到指定地点集合。“既要求快速不乱，又要求肃静无哗”。经过这样几次演练熟悉之后，又按顺序练习夜间行军、夜间战斗、夜间筑城(即挖战壕)，最后实施单兵和诸兵种的联合演习，以提高其夜间战斗能力。这种夜间训练的效果明显，在许多战役中均发挥以弱胜强作用，它能补装备不强之短，扬短兵相接之长。北伐战争后，冯玉祥和阎锡山联合反蒋的几次战役，冯军利用夜间偷袭的战术，取得了多次胜利。1930年5月31日，冯玉祥部郑大章所率领的骑兵千余人，于夜间突袭陇海线上的归德飞机场，烧毁蒋军飞机12架，俘虏机场人员近百人。
与此同时，石友三部也在陇海线夜袭敌军，连连获胜，使蒋军产生畏战情绪，士气低落。由此可见，冯玉祥在西安训练部队时注重夜间军事训练，在此后实战中发挥的重要作用。
对于西安红城整训部队的这一段经历，冯玉祥本人多年后都难以忘怀，常能记起某些场景。在他所著《我的生活》一书中多有记载。
“某日课目为刺枪，即先教官长整个动作，官长会了，即由他领开队伍，细细教与士兵，而后一一检查。这时已经8点，吹号停操，即在操场上与官长士兵共同吃早饭。自总司令以至士兵都是一样的菜，一样的饭，完全实行同甘共苦的教条。
饭后，操练重新开始，目测距离，利用地场以及各种战斗动作，均一一教练，也是先教会了官长，而后由官长去教士兵。切切实实实行“兵会者官长先会”之教条，并废弃徒重形式与传统式的教练。到10点半吹号，召司务长送开水，喝完水又操，直到下午4点钟，方得散队伍停止操练。惟留营长以上官长，细问其所部一切状况。有何困难，发生何事？病者伤者多少，病况伤况如何，而后分别派人去问视伤病。从操场回来，我即率中级官以上到讲堂，听讲战术及政治讲演，都请由专家名流分别任之。讲至晚8点……”②冯玉祥：《我的生活》（下），第543页。
对于这种训练方法，许多人为之惊叹。一日，有曾任靖国军旅长小名高景娃的故旧前来见冯玉祥，但冯练兵时的晨会已开始，无法与冯面谈，于是想看看操练便走。不料，越看越入神，越不想回去，先是站着看，后来便蹲着看，再后来便靠墙跟坐着看，整整看了一天，直到操练结束。足见操练的情景，令人入神。
从1926年12月至1927年4月，冯玉祥在西安对其所属部队的大力整训，使部队官兵的精神面貌和军事技术均有了显著变化。一些过去缺乏训练，尤其缺乏军事训练的部队，整体素质“进步飞快，气象日见振作”。
制定和实施行政纲领
冯玉祥到达西安后，除继续安抚和赈济市民、祭奠阵亡将士、整训所属部队外，主要从军、政两方面采取各种措施，做好策应北伐的各种准备。为保证在战乱时期，各级军政机关能够担当重任，统一各方势力，他宣布：国民军联军总司令部是国民军辖区的最高政权机关，统管辖区的党、政、军、民一切事宜。同时制定和颁布了《国民军管辖区域军政时期临时行政大纲》，要求国民军各部和地方党政机关一体遵照执行。
《行政大纲》指出：
国民军管辖区域，与国民政府因交通梗阻，未能确实联络。在军政时期，为行政统一及革命军事便利起见，根据建国大纲……并参照国民军管辖区域内特殊情形，制定国民军管辖区域军政时期临时行动大纲，一俟国民政府能直接指导时，有与国民政府法令抵触之处，应修改之。
《行政大纲》规定国民军联军总司令部的职权是：
1．国民军联军总司令部，为国民军管辖区域内军事民政最高机关。对于本军管辖区域内各部队、各级职员、各机关，有统辖之权。
2．国民军管辖区域内，所有各部队管理、编制、训练、指挥、军队中政治组织及一切军政实施事宜，均由联军总司令统一之。
3．国民军管辖区域内，对内对外，一切政务，统由国民军联军总司令主持。但带有地方性质及有特殊情形者，得由地方最高行政机关，按照本临时行政大纲，订出计划，呈报联军总司令核准施行。
4．国民军管辖区域内，一切行政实施，力求划一，但有特殊情形者，另定之。
5．国民军管辖区域内，一切财政，力求统一。
6．国民军联军总司令，对于国民军管辖区域内一切职员，有任免之权。
7．国民军联军总司令，代表国民政府，行使一切奖惩之权。
8．国民军各省驻军总司令，及省政府，承联军总司令之命令，分管一切军政民政事宜。但在作战时期，戒严地带，由联军总司令规定。各省驻军总司令，得指挥民政事宜。
9．凡国民军管辖区域内，关于更订法制事项，应由联军总司令部，设法制委员会拟订，由联军总司令核定实施。
10.凡国民军管辖区域内，一切兴荣事宜，得由各地方机关、及各种社会团体，拟具意见，陈由联军总司令核定实施。
11．凡国民军管辖区域内，一切军政行政设施，应与各级党部，发生密切关系。
12．本大纲由联军总司令部命令公布实施。
转引自李秦棻《国民军史稿》。
为了改革吏制，澄清政治，至1927年7月，冯玉祥先后颁布一系列政令，要求各级官员革除官场作风，振奋革命精神。
2月22日，冯通令颁布《军政长官应遵守者十条》。《十条》强调了军政长官以身作则的重大意义。指出：“本军努力革命，原为扫除旧社会一切恶制度，恶劣风俗，使国人俾政，人皆良善。故革命党人，所认为应该改革者，必从自己做起，否则不能期人之相信，而使其必从。”
转引自李秦棻《国民军史稿》。
冯玉祥在通令陕甘各部队及县长、局长以上各官吏的训词中指出，“照得革命期间，万端待理，无论军政人员，首应扫除不良习惯，方能协赴时机完成革命工作。盖官吏乃民众之公仆，负党国之使命，虽有职司之不同，官阶之差等，然在政治上所负之责任皆较重于一般民众。
苟不勤慎竭力，夙夜求其进步，则其影响所及，足以颠覆党国而有余。年来，我军区域内各文武官吏热心任事者不乏其人，而仍沿往日泄泄沓沓之积习，毫无振作之精神者亦复不少。
本总司令与各文武官吏同负党国之重任，均应各自振拔，努力向前，以免贻误大计。兹有目前亟须注意者三事，分列告诫，务期各文武官吏一致奋发勉励，党国前途，于此是赖。
1．务迅速：官署事务关系甚重，无论省署、道署、县署、以及其它机关，其所司所职，无不与民众有密切关系，而军事方面尤为特要。各文武官吏无论办理何事，进行何事，均应从速，不宜延宕。……须知官吏为人民之公仆，民众利益之维护，皆为公仆是赖。在此革命政府之下，决不容有如此怠情之职员。嗣后，凡在我军管辖区域以内，各文武官吏办理事务须随到随办，力求迅速。无论何事，至迟不得逾越三日，即遇繁重事件，须预定最短期间，尽可能的迅速办理了结，不得稍延，务须特别注意。
2．务切实：我国官场旧习，素尚敷衍苟且了事，暮气沉沉，不知振作。对于职责所司，毫不注意，不求实际，徒务外观。各下级官署对于上级官署发布命令，往往不论事关重要与否，只以空文搪塞，而不身践力行，迨到事败，极力弥补，自误误人，莫此为甚。在上级官既失考核之方，而下级官因得用其饰伪之巧。长此以往作奸败事，何堪设想。今与我军管辖区域内文武官吏约：自兹以后，无论办理何事，总以脚踏实地努力践行为第一要义。如遇一事务，不可只假书记之手行一空文，尤不可托传事者之口一说了事。必须实事求是，毫不客气，办一件事是一件事。做一项完一项，不得敷衍塞责，自欺欺人。尚再承袭劣风，仍蹈恶习，一经查觉，定既重罚不贷，各文武官吏其各勉旃。
3．守时刻：不守时间，已成吾国人之习惯。前清衙署办公时间无有定例，以致养成官吏办事迟缓恶习。民国以来，各衙署办公时间早有规定，乃一般官吏仍沿旧习，装腔作态，往往逾期不至，于是相演成风，恬不为怪。其在司法行政机关，往往因琐事传闻，致废一日一周之光阴，甚至数月数年而不予以相当之判决，卒使人民悬系心胸，而不得乐安生业，其它影响尤不可胜地。此种不守时间之大弊，万万不能存留，况本军努力国民革命，尤以涤除污恶风气，打破官僚积习为急务。凡在我军管辖区域内，文武官署对于办公时间已有规定者，务须按照实行。其未经规定者，着速规定，切实遵行。他如军队集合，政务会议诸端，尤应遵守时刻，不得逾期不至，方足以表现整齐严肃之精神，藉收共同动作之功效也。以上三端，各该管主官，务须切实提倡，认真刷新，处处具充分革命精神，勿以琐碎而玩愒，除分令外，仰即转饬所属，一体注意办理，是为重要。”《国民军联军总司令部训令》，《冯玉祥在陕西》，第299~301页。
《军政长官应遵守者十条》对各级官员的规定更加具体。如：第一，下级职员，不可向长官馈送礼物。第二，军政服务人员，均不可有带政治性而不属于利己行为之互相请托。第三，凡军政服务人员，不可随便宴会；如有外宾及特别事故，必须宴请时，每人膳费，不得超过l元。第四，凡军政服务人员，无论何地何时，不可有向他人需索财物及收受政费等事。第五，凡军政服务人员，不可借公事向人市惠买好。各级高级机关人员，尤须特别注意。第六，凡军政服务人员，无论对于何人，均须谦和有礼，不可少涉傲慢及借势凌人。第七，凡军政服务人员，无论何处办事，不可借势招摇，一切言语，务须十分戒慎。第八，凡军政服务人员，应力戒阳奉阴违之恶习。对于已经公布之事项，不得发表相反之言论。如有意见，可条陈本营长官。第九，凡军政服务人员，不得为个人利益而私立派别，妄分轸域。第十，凡军政服务人员，彼此均宜推诚相与，互相勉励。如见同人有过失时，须婉言规劝，不可当面敷衍，背后讥诮。李秦棻：《国民军史稿》。
对旅长以上的高级军官军政素质提出更高要求，冯玉祥下令颁布了《诰诫高级军官十条》，分别提出：革命化、勤学问、宏器度、办事理、慎言行、谨用人、明赏罚、体兵情、励道德、有恒性。对上述十个方面的告诫，冯玉祥都有具体说明和要求措施。而且他还宣布，他将“随时考查，督促进步，别其勤惰，以定惩赏”。《冯玉祥在陕西》，第335～339页。
由上述所颁命令及通告看，冯玉祥在国民革命的影响下，思想转变，倾向革命，因而在治军、治政过程中坚持民族民主革命的主张，并力求政治和军事的革命化。此后，不仅陕西地区而且国民军联军所辖的甘、宁、青、察等地，以及国民军联军所属各部队都得到推行，对提高国民军整体素质，推动国民革命运动，收到了良好效果。
创办“第二黄埔”中山军事学校
1927年3月，冯玉祥进驻西安不久，便在中共北方党组织的支持和协助下，在西安创办了被称为“第二黄埔”的中山军事学校。它作为专门培养军事政治干部的正规军官学校，与广州黄埔军校，形成南北辉映，相互媲美的两座革命熔炉。
中山军事学校校址设在西安东郊，学校名义上归国民军联军驻陕司令部管辖，实际上是由中共直接领导和掌握的。
