蜀国无大将，廖化当先锋，后金随着老干部逐渐老化，储英等势力遭到削弱，代善成为的主力，他被任命为前线先锋，率军保护尚间崖，三月初二早晨双方交战。努尔哈赤率领亲卫军及二旗众兵全体离营，登上一个山坡瞭望。努尔哈赤见大明营内军兵与营外军兵汇合，就命令开始跟明军作战。于是代善就从山的左侧，也就是南坡下山到山脚下，命令他的二旗士兵下马准备步战。下马的人才四五十个人，大明军队就从西面来攻上来了。代善对努尔哈赤说："我应当领兵前进。"随即策马迎敌，直杀入明军的队伍中。诸贝勒与各位率兵的台吉等也紧随代善杀向明军，两军混战，明军败退，进攻的明军被杀大半。随即，代善又转战斐芬山，击败明朝潘宗颜部。三月初五，代善又与其他三大贝勒合兵全歼了明朝总兵刘铤的军队，后金国取得了萨尔浒战役的胜利，代善的勇猛和才华得到进一步展示和充分认可。
明军大败后，许多贝勒都主张杀掉前来为明助战的朝鲜元帅姜弘立等。但代善不赞成，他搞起了多边国际外交，认为朝鲜是可以争取合作的对象，后金就这几杆枪，不能既与南面的明朝相战，又与背面的朝鲜作对，应该避免打两个战场的战争，这个想法得到了努尔哈赤的认可。当朝鲜军队元帅姜弘立率领剩余的五千兵下山来投降，因不以后金礼节拜见努尔哈赤，努尔哈赤发怒并欲尽斩朝鲜将卒以后快时，又是代善出面阻止，代善说“阵上和约已指天为誓，若将他们杀掉天所不容”，并建议将朝鲜军队尽数释放回朝鲜国。最后，与朝鲜暂时达成了修好之议，朝鲜的军队陆续撤回到了自己国内。朝鲜问题历来是中央王朝必须面对的重要问题之一，处理不善满盘皆输啊，杨广三次远征高丽，都没有成功，最终导致他兵败国灭的下场，英明神武的唐太宗李世民也是几次攻打高丽，都没有获得好果子吃，最终还是在唐玄宗时代完成了对高丽的征战，并控制了高丽。可以说，努尔哈赤及代善处理朝鲜问题还是算成功的，自己实力不强大的时候，和平外交，解决自己后顾之忧。
萨尔浒之战后，后金军乘势攻占开原，1619年(天命四年)农历七月二十五日，代善跟随努尔哈赤进攻铁岭。攻占铁岭城之后，代善率兵进击潜伏于高梁地内的蒙古齐赛贝勒所率领的万余蒙古兵，蒙古兵溃败至辽河，代善大杀其兵于辽河。代善生擒蒙古贝勒齐赛及其生子色特奇尔、柯希克图二人、扎鲁特图巴克、色本兄弟、科尔沁明安贝勒之子桑噶尔寨等，共贝勒六名，及齐赛贝勒之亲信大臣岱噶尔塔布襄以及大臣十余人，共一百五十人。
1619年(天命四年)农历八月十九日，代善跟随努尔哈赤发兵进攻叶赫。二十二日晨，兵抵叶赫，代善和阿敏、莽古尔泰，领兵攻陷叶赫西城，努尔哈赤攻取东城，叶赫部贝勒叶赫那拉·布扬古(代善妻弟)与其弟布尔杭古遣使请降，并请代善立誓不杀。代善同意，并与布扬古及其母(代善岳母)盟誓，布扬古于是投降(后遭缢杀)，布尔杭古贝勒由代善领回自己家中。代善这位二师兄不仅在战场上赢得了胜利，在宫廷决斗中也获得了胜利。
打到了储英之后，代善成为最大的赢家，在诸子中年岁居长、且是原配嫡生，骁勇善战，军功卓著，拥有正红旗、镶红旗二旗，努尔哈赤就让代善代理政务，相当于储君的位置，但是没有明说，只是对众人说：“等我百年之后，我的诸幼子和大福晋交给大阿哥(指代善)收养。”因此，在储英、舒尔哈齐相继倒台后，后金王朝二号人物非代善莫属，一时间权势显赫、春风得意。关羽都能大失大意荆州，况且代善呢？一旦你拥有了权力，各方力量都会瞄准你，围猎你，怀着各种目的取悦于你。代善自然而然地碰到这样问题。多尔衮的妈妈阿巴亥与代善年龄相仿，30岁左右，二努尔哈赤60多了，有了代沟。特别是代善作为接班人的趋势似乎越来越明显了，阿巴亥就开始巴结代善，好为自己后半生打算。因为在满洲，老子去世后，老爹的小老婆是可以作为财产继承下来的，反正阿巴亥迟早也是代善的人。就这样，代善和阿巴亥一来二去两人走得比较近了，经常私下里见见面、吃吃饭，这就是信号啊，谈恋爱都是从约会、吃饭开始的，他们逐渐发展成为地下情人关系。一直觊觎汗位的皇太极抓住了这个机会，像代善发起了致命一击。皇太极与努尔哈赤的小妾德因泽走得近，两个人一起交换情报，德因泽汇报宫中女同志之间的恩怨情仇，皇太极通报外面的世界形势。因此，他们联合起来发动了高密行动。1620年(天命五年)农历三月，努尔哈赤的小妾德因泽告发努尔哈赤的第四位大妃乌拉纳喇氏阿巴亥(多尔衮之母)曾两次备饭送给代善吃，代善接过去吃了。而且大妃一日两三次差人至大贝勒家，还曾深夜出院二三次。在审理过程中，诸贝勒大臣又说他们都目睹过大福晋借宴会或议政之时对代善眉目传情。努尔哈赤听说此事，鼻子都冒青烟了，亲自安排自己亲信的8个大臣成立专案组，进行取证调查。代善和阿巴亥两人也承认了彼此之间的确有些交情，但在别人的添油加醋之下，整个局面变得不可收拾。努尔哈赤对此又恨又恼，但终因其有言在先，欲将诸幼子及大福晋交由大阿哥抚养，而且满族历来有父死子妻其庶母的收继婚俗，加上又没有确凿的证据证明代善如何不轨。面对这种“绯闻”越传越邪，逼得努尔哈赤没法收场，逐步消弱了代善的权力和职务，努尔哈赤以大福晋窃藏财物的罪名，将阿巴亥休离。代善虽没有因此获罪，但经过此事，代善的威信一落千丈。这样一来，皇太极胜出的希望越来越大，他正向汗位阔步迈进。
墙倒众人推，在代善被生活问题闹得沸沸扬扬的同时，他的家庭又出现了内部矛盾。1620年(天命五年)三四月间，后金国准备从界藩城迁居萨尔浒城，努尔哈赤视察并指定各贝勒兴建府邸的宅地。代善看到其长子岳托修整好的宅地比自己的好，就先后让莽古尔泰和阿敏为自己请命说自己所居之地狭小，意欲霸占岳托的宅地。
1620年(天命五年)九月初三日，代善次子爱新觉罗·硕托(岳托的同母弟弟)因为无法忍受代善的虐待而突然失踪，有人说其"叛逃"投明朝而去。在还未确定硕托是否叛逃时，代善即一口咬定硕托有叛逃之心；在找到硕托并且其本人明确表示并没有叛逃后，代善还是向努尔哈赤跪下五六次请求斩杀硕托。代善的要求遭到了拒绝，努尔哈赤释放了硕托。
努尔哈赤由此开始调查代善给予两个前妻之子的待遇问题，发现代善之子岳托、硕托所领有的资产均比其他的异母弟弟差。因此努尔哈赤怒斥代善说，你也是前妻的儿子，何不想想我不是对你更亲近吗？你怎么就被后妻蒙蔽得虐待已长大成人的儿子呢？何况我待你一直是特选良好的部民让你专管，你为什么就不能像我一样将优良的部民赐给岳托、硕托呢？
努尔哈赤让岳托、硕托与代善分家，并公开宣布废掉代善的太子之位。代善这个孩子被废除时候，努尔哈赤非常痛苦，他与自己结发妻子第二个儿子被废除了，就没有嫡子继承汗位了，如何是好呢？他犹豫了，他彷徨了，因此再也没有提起谁作为储君的事情。这样更激起了争斗，因为努尔哈赤已经不小了，接班人肯定要有的吗。
代善被废除嗣位后，于1620年(天命五年)农历九月二十八日，亲手杀掉继妻以向汗父谢罪，努尔哈赤要他与诸弟发誓，今后如再怀恨众贝勒、大臣，甘愿受天地处罚。努尔哈赤宽容了代善。代善尽管被废除了太子位，但没有受到致命打击，给予了他改过自新的机会，仍得为四大贝勒之首，参与治理国政。
1621年(天命六年)农历二月，代善、阿敏、莽古尔泰、皇太极这四大贝勒分月值理政事。
1621年(天命六年)农历三月，代善率领正红旗、镶红旗二旗兵丁，跟随努尔哈赤，攻克沈阳、辽阳。同年农历七月，辽东镇江(明代辽东地名)兵民起义，代善奉努尔哈赤之命，和莽古尔泰和督堂阿敦，领兵二千，迁移金州沿海居民于复州。同年农历十一月，代善在银库取银六万六千两，分赐八旗官兵。
1622年(天命七年)农历二月，代善与皇太极率正红旗、镶红旗、正白旗三旗，去义州驻防，斩杀义州拒绝降顺的汉兵三千人，又将右屯卫汉民四千五百五十七丁、八千八百六十四人及马、牛、驴三千余匹(头)，驱往金州。同年农历四月，为示友好亲密，金国汗、贝勒与来归的蒙古诸贝勒"结成亲家"，代善的亲家是莽果尔额驸父子、绰尔济、密赛、伊林秦、额布根、伊思阿布和代青之子拜音岱，其蒙古亲家之多，超过阿敏等其他贝勒。他又带领杜度贝勒、济尔哈朗贝勒和扬古利总兵官，率兵一万余，前往广宁换防。
1623年(天命八年)农历二月，代善偕二贝勒阿敏，领兵前往锦州、义州一带，捉拿来此运粮的蒙古兵。同年农历六月，代善奉汗命，和斋桑古等四位贝勒，带兵二万，前往复州镇压汉民起义，获胜后返回。同月，复州复御王炳、永宁监备御李殿魁，分别向代善告密督堂乌尔古岱收受贿物，代善转告汗父努尔哈赤。诸贝勒审理后，拟将乌尔古岱处死，并指责皇太极、德格类、济尔哈朗、岳托四贝勒有过，请努尔哈赤惩治。努尔哈赤痛斥皇太极骄傲愚昧，谕令罚取四位贝勒牛录。农历八月二十日，努尔哈赤下谕，指出诸贝勒都有过错，次日，诸贝勒上书自责。代善上书说："当初父汗指出我的过错，我不听从，犯了罪，父汗与众弟仍以礼恩养。我若不深切念此爱护，对我的过失，如仅仅伪言追悔，是我的过错，而在心中仍认为我正确，皇天岂能宽恕我？不要忘记我的过失。我每每想起自己的过错，后悔不已。今后我一定要摒弃恶行，勉励自己行善。如若再有过失，我身将遭殃祸。"
1626年(天命十一年)农历八月末，努尔哈赤病逝。由于实行汗位继承由八和硕贝勒共同推举制，四大贝勒代善、阿敏、莽古尔泰和皇太极都手握重兵，怀有夺取汗位的打算。他们会不会火并呢？或者各自带领人马，自立山头呢？导致刚统一的女真再次分裂呢？好戏还在后头呢？
