四年，秋八月，虏酋孛来大举入寇，自大同、威远西拥众南行。边将高阳伯李文按兵不敢当其锋。已而，虏众直抵雁门关、代、朔、忻州一带，四散抢掠，炮火彻于京师。人民惊疑，弃家走避， （「弃家走避」，「走避」原作「北走」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 拥入京城莫能止。上初谓此虏穷乏，不过在边抢牛羊而去。贤见人民惊走如此，乃言于上曰：「京师宜出军于紫荆、倒马二关驻札，非欲与之对敌，一则安抚人民，一则使彼知惧，不致深入久停。」上方欲命总兵者议，会兵部奏，欲遣将统京师军赴大同杀贼。 （「会兵部奏欲遣将统京师军赴大同杀贼」，「欲」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 上曰：「缓不及事，徒劳人马。驻关之说可行。」于是，遣都督颜彪领兵赴紫荆关，冯宗领兵赴倒马关。然此虏既有所获，见我兵不动，去而复来，遂复敕二关之军赴雁门。人民恃此以不恐。上意初不欲，虽勉强而从，终不悦。后见此虏复来，始以为然。人亦谓贤多言，贤曰：「古之大臣知无不言，今虽不能如此，于此等利害，国家安危系焉，不言可乎？纵得罪疏远，不可顾也。」
四年秋，上召贤与王翱于武英殿，曰：「今兵部、工部缺侍郎，卿等择人用之。」贤谓：「副都御史白圭可为兵部侍郎， （「副都御史白圭可为兵部侍郎」，「白圭」，原作「白珪」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本及明史卷一七二白圭传改。） 其湖广巡抚亦暂设耳。」上以为然。翱曰：「南京户部侍郎马谅服制将终，可转工部。」上亦以为然。谅至，适户部亦缺人，因上召言及谅，贤以为舍正缺而他转，班序反出其下，莫若就命以户部。上以为然。命下，舆论亦惬。翱亦曰：「如此处置，甚安。」谅自南京府尹升此职，钱谷之事久经心矣，贤非一时自定， （「贤非一时自定」，「自」原作「所」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 盖亦素闻众论耳。
四年冬，闰十一月十六日早，见月食。钦天监失于推算，不行救护。上召贤曰：「月食人所共见，钦天监失于推算如此。」因言：「汤序以礼部侍郎掌监事， （「因言汤序以礼部侍郎掌监事」，「以」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 凡有灾异必隐弊不言，或见天文有变，必曲为解说，甚至书中所载不祥字语多自改削而进，惟遇天文喜事却详书以进。且朝廷正欲知灾异以见上天垂戒， （「且朝廷正欲知灾异以见上天垂戒」，「上」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 庶知修省，而序乃隐蔽如此，岂臣下尽忠之道！」贤曰：「自古圣帝明王皆畏天变，实同圣意。序若如此，罪可诛也。」上曰：「今有此失，法不可容。」于是收下狱，降为太常少卿，仍掌监事。
四年十二月六日。 （「四年十二月六日」，「六日」原作「十六日」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 上于奉天门朝罢召贤曰：「吏部右侍郎不可久缺，况尚书王翱年老，早得一人习练其事。」命与翱访其人，得巡抚南直隶副都御史崔恭。明日早于文华殿具奏，上喜，以为得人，以山东布政刘孜代巡抚。因论人才高下，上曰：「若徐有贞，才学亦难得，当时有何大罪？只是石亨、张軏辈害之。宁免后世议论，可令原籍为民。」贤与翱曰：「圣恩所施最当。」即传旨下之户部。
天顺五年正月，大理卿李茂卒。上召贤曰：「大理寺是审录官法司，囚徒皆从此，平允至为紧要。今虽有寺丞二人，名分犹轻，恐不敢与法司持辨，须得职稍重者一人，卿可择之。」贤请与吏部尚书王翱议，上曰：「然。」于是议以旧卿李宾最宜，但忧制未终。明日，见于文华殿，上曰：「得其人矣乎？」贤与翱以宾对，遂用之。
五年二月，因锦衣卫指挥所行江西弋阳王败伦事涉虚，上召贤曰：「宗室中岂愿有此丑事？彼初既以为实， （「彼初既以为实」，「彼」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 今却云无此事，以此观之，其余所行，枉人多矣。」贤曰：「诚如圣谕。」因言法司明知其枉，畏避此辈，不敢辨理。贤曰：「须旨意付法司， （「须旨意付法司」，「须」原作「若」，据明古穰文集本、明纪录汇编本改。） 但有枉者与之辨理，不许畏势避嫌。」上曰：「然。」于是召法司戒饬之，人人皆悦。一日，上言及此事，贤曰：「清平之世，若刑狱枉人，实伤和气，惟陛下明见如此，斯民幸甚至！」
天顺五年四月，上召贤谓曰：「今府库钱粮所入者少，所出者多，奈何？且军官俸一季关银十四万余两。」贤曰：「自古国家惟怕冗食，今一卫官有二千余员者。」上曰：「一年四季或以一二季支与布钱，如何？」贤曰：「须与户部议。」一日，上召贤，曰：「同吏、户、兵尚书议此事。」上曰：「尔户部奏来，朝廷复命会议。不然，不惟归怨朝廷，亦归怨尔类人矣。慎密之。」贤因言：「在京军官老弱残疾者，令兵部渐调出在外，却以军补其缺，以省冗费。」上曰：「此事特恐难行。」贤曰：「宜安静行之，如无事，然使其不觉可也。」上颔之。贤又言：「军官有增无减，且天地间万物有长必有消，如人只生不死，无处着矣。自古有军功者，虽以金书铁券，誓以永存，然其子孙不一，再而犯法即除其国，或能立功，又与其爵，岂有累犯罪恶而不革其爵者？今若因循久远，天下官多军少，民供其俸，必致困穷，而邦本亏矣，不可不深虑也。」上曰：「此事诚可虑，当徐为之。」
自天顺四年水灾以来，天下米谷皆贵，人民艰难。至五年尤甚，贤深忧之。六月中，因陕西、凉州、庄浪一带虏寇侵犯，围困城堡，日久不退，及遣将官仇廉领兵自兰州过河与庄浪合兵，又被虏贼截路杀退，贼益猖獗，过河抢掠羊马财物，官军莫敢与敌，关中震恐，乞大军剿杀。于是，以兵部尚书马昂总督军务，怀宁伯孙镗为总兵官，京师出军一万五千，河南、山东调军二万。贤因此事与会昌侯孙继宗、吏部尚书王翱及马昂四人言于上曰：「今天下人民艰难，况又起兵，宜宽恤以苏民困。」上有难色，不得已而允之。太监牛玉亦闻下情如此，力赞行之。于是，开写十数条最苦于民者，悉皆停止。
内官吉祥居禁庭最久，为人惟喜私恩小惠，招权纳贿，擅作威福。尝往云南、福建杀贼，带去达官军能骑射取功，因而收于部下，加以恩泽，为腹心。天顺初，呼召此辈迎驾，俱升大职。此辈亦感吉祥之恩。后石亨事发，冒官者俱革去，此辈又为吉祥所庇不动。吉祥初以迎驾功，贪图富贵，以荣一家，弟侄俱各得大官。又卖官鬻狱，渎贷无厌。 （「俱各得大官又卖官鬻狱渎货无厌」，原无，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 上初不得已而从其所欲，后不能堪，稍疏抑之。吉祥辄坏异志，令其侄昭武伯钦纠集所恩之人谋为不轨。会兵部尚书马昂、怀宁伯孙镗统官军往陕西杀贼，于五年七月二日早辞，钦等乘机欲杀马昂、孙镗等，就拥兵入内为变。幸而孙镗等先觉，二鼓时即报于内，禁门不开。钦兄弟与同恶者先诣锦衣卫指挥逯杲宅前，遇杲方出，斩其首，碎其尸。盖杲亦吉祥所恩之人，后朝廷委任行事， （「后朝廷委任行事」，「委」原作「奏」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 且言钦非理之事，所最恨者，先害之。然后分布于各禁门，待其开拥入。三鼓至门，钦兄弟四五人俱在东长安门。
予四鼓到朝房， （「予四鼓到朝房」，「到」原作「列」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 闻抢马惊乱，以为出征之军。及入房，闻呼：「锦衣卫指挥焦寿、郭英等拿住」，予亦不知何如。俄，人呼予官名，曰：「寻李学士。」予方恐，即出房至门前，见披甲持刀者数人，一人砍予一刀，又打一刀背。曹钦适至，见予不忍杀，连呼尊长，执予手曰：「毋恐。」叱退持刀者，且告曰：「我父子兄弟尽忠迎驾复位，今被逯杲谮毁，反欲相害。」提杲头示予曰：「诚为此人激变，不得已也。」予曰：「此人生事害人，谁不怨恨。既除此害，即可请命。」钦曰：「就与我写本进入。」即令人防予，至吏部朝房尚书王翱处借纸笔写成，予拉翱同行，于门缝投进。钦见门不开，乃举火焚，且复欲害予，令持刀者同予寻尚书马昂，得翱等解之。及天明，上马呼众，驰往东安门，又令披甲持刃者一人驰马寻予，翱等复解之。忽有孙镗领官军袭而围之，予乃得脱。时恭顺侯吴瑾、左都御史寇深俱被杀死，予被伤。
在吏部，至晚大雨不止，闻官军围钦等于其宅， （「闻官军围钦等于其宅」，「闻」原作「又」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 尽诛之。予虑其胁从者不宁，即投本进入，请急宣圣旨， （「请急宣圣旨」，「请」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 胁从者罔治，以安反侧之心，然后诏之天下，布宽恤之恩。一切不急之务，悉皆停罢，与民休息。吉祥已正典刑，盖此乱臣贼子肆行反逆，天地鬼神所不容。当时若不早觉，各门既开，此贼拥入纵横， （「此贼拥入纵横」，「此贼」二字原无，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 一时不能御之，其祸不可胜言，毕竟就戮，被其伤害多矣。幸而早扑灭之，此实宗社之福也。
自天顺元年石亨窃弄威权，恨御史杨瑄攻其家人侵占民田，谓贤与徐有贞主使，被其诬害，言官方欲劾其不法，亨先知之，即言御史听有贞主使，排陷大臣，遂将都御史耿九畴等置于狱，十三道掌道御史尽置于法，从此言路闭塞，近侍、风宪无一人敢言者。由是权奸得志，肆行无忌，相继反逆。贤因言于上曰：「自古治朝未有不开言路者，虑臣下不肯进言，有设敢谏之鼓、诽谤之木者，或导之使言，或设不言之刑以惧之。有直言者，或旌异之、褒奖之、赏劳之，升用以劝其言， （「升用以劝其言」，「言」原作「一二」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 然后臣下始肯进言。且进言者不过言君德之亏欠、刑政之阙失、天下生民之利害、文武百官之贪暴奸邪，皆是有益于国家之事，于己无益也。不但无益于己，又恐触上之怒而得罪焉。圣帝明王有见于此，故惓惓求言，惟恐不得闻其失也。惟奸邪之臣，恶其攻己，务欲塞之以肆其非为，莫敢谁何，由是覆宗绝嗣而不悟也。」上曰：「此事吉祥、石亨、张軏、杨善实塞之，今宜速开，可于诏书内列之。」贤曰：「此宗社之福，苍生之幸也。」于是，言路方开。
都御史寇深被贼害之，上顾贤曰：「此职非轻， （「此职非轻」，「职」原作「地」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 须得其人。」贤曰：「宜命六部共举。」既而举三人，以南京刑部尚书萧维祯居首。上命贤用一人，贤以居首者对。上曰：「此人曾在吉祥处通情，吉祥力荐之，非端士也。」复询六部，皆曰：「但以其曾居此职，遂谓老成，不知其所为如此， （「不知其所为如此」，「为」原作「谓」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 诚不可。」上复问，贤曰：「大理卿李宾年虽少，容止老成，久典刑名，可当此任。臣所见如此，须从众论。」上召王翱等询之，皆曰：「可。」 （「上召王翱等询之皆曰可」，「曰」字原缺，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本补。） 遂升右都御史。
八月十六日，上敕吏部曰：「学士李贤为贼所伤，乃能力疾供事，忠勤可嘉，特加太子少保，如敕奉行。」贤即具本辞免。上曰：「官以酬劳，朝廷自有公论。卿宜承命，所辞不允。」明日，上召问曰：「先生何故恳辞？」贤曰：「臣实不敢受此加秩，乞容臣辞免。今再进本。」上曰：「先生劳心国事，非他人比，虽进本十次亦不允。」贤不得已，受之。客来必曰：「佥谓先生受此职视前任者士望尤未满也。」 （「佥谓先生受此职视前任者士望尤未满也」，「满」原作「允」，据明朱氏国朝典故本、明古穰文集本改。） 予曰：「朝廷名器不可多用，徒多兼美秩，不思所干之事称否。若能尽职务，虽不兼官亦有光，不然，虽兼十官亦非美，祇取士林之讥诮也。且景泰间，任其自择好官兼之，累至五官，太子太保一升十员，名爵之滥至于此，不三数年，革之一空，能免诛谪以礼去官者两三人耳。韩子所谓『必有天殃者也。』士大夫宜以此为戒，不可贪一时之荣，而忘远虑也。」
五年十一月二十日早，上召贤至文华殿，因说吉祥事曰：「此辈放纵，前日见吉祥败，稍收敛，近来又放纵。朕每戒曰：『汝等不可如此，且如吉祥，非无功劳，一旦犯法，不可留矣。且朕在南城时，汝辈如何过来？今日不可忘了。朕今在位五年矣，未尝一日忘在南城时。』此等言语，常时告戒，先生岂知？」贤曰：「古昔圣贤之君，正是如此。安乐不忘患难之时，又以此戒左右之人，最善。」
上言：「朕一日之间，五鼓初起拜天，虽或足疾不能起，亦跪拜之。拜毕，司礼监奏本，一一自看。朝庙行拜礼，入庙皆然。出则视朝，退去，朝母后毕，复亲政务。既罢，进膳，饮食随分，未尝拣择去取。衣服亦随宜，虽着布衣，不以为非天子也。」贤曰：「 如此节俭，益见盛德。若朝廷节俭，天下自然富庶。前代如汉文帝、唐太宗、宋仁宗皆能节俭，当时海内富庶。惟耳目玩好不必留意，自然节俭。」
