三个月后的1969年10月17日，组织决定萧向荣去“五七”学校劳动改造。10月19日他登上火车，21日到达“五七”学校。26日，他被分配到5连2班，开始了“五七”学校的劳动生活。在劳动满20天的时候，他自己做了一个小结：要重振革命精神，老老实实地做个普通劳动者。在“五七”学校，萧向荣被停止了党的生活，还不准他戴领章帽徽，不准他听报告、看文件和参加会议，在没有任何政治权利的情况下，他仍然坚持学习马列主义基本理论。每天劳动之后，吃过晚饭，擦过冷水澡，他就开始看报读书，阅读《国家与革命》、《共产主义运动中的“左派”幼稚病》、《反杜林论》、《共产党宣言》等经典著作，同时思索“文化大革命”出现的种种情况，逐步地由怀疑到清醒。1971年，林彪摔死在温都尔汗，萧向荣和全党一样，心情大快。他根据自己的切身体会，对“五七”学校得出结论：“自远出河南，三迁寒暑；名曰‘疏散’，实作‘囚徒’。所谓‘五七’劳动学校实际上已经变成劳改队了。”
1972年，在叶剑英副主席的关怀下，萧向荣结束了三年“五七”学校的劳动生活，回到北京治病。1973年6月、10月，萧向荣接连给叶副主席、周总理、毛主席写信，申诉自己遭到林彪打击迫害的经过。1975年，中共中央任命萧向荣为国防科委副政治委员。1978年12月19日，总参谋部党委作出了《关于为萧向荣同志平反昭雪的决定》。《决定》指出：“萧向荣同志是中国共产党的优秀党员。他的一生光明磊落，忠诚坦白，对党的事业忠心耿耿，鞠躬尽瘁，为我军建设作出了重要贡献。在与林彪反党集团斗争中，他立场坚定，旗帜鲜明，坚持原则，敢于斗争，表现了无产阶级革命战士坚贞不屈的高贵品质。”《决定》推倒了林彪、叶群强加给萧向荣的一切污蔑不实之词，10年沉冤，终于大白。萧向荣得到了平反，恢复了名誉。
1975年萧向荣到国防科委工作后，积极支持国防科委主任张爱萍的工作，他们坚决贯彻当时主持中央工作的邓小平提出的“军队要整顿”、“把国民经济搞上去”、“必须坚决同派性作斗争”的指示，在国防科委进行清除资产阶级派性的斗争。这一斗争刚一开展，张爱萍就遭到“四人帮”指使的一些人的无理攻击。有的人甚至猖狂地叫嚷：“要同张爱萍斗争到底。”萧向荣挺身而出，理直气壮地指出：“张爱萍同志是毛主席派到国防科委工作的，执行的是毛主席的革命路线。你要同他斗争到底，把自己摆到哪里去了？”
1975年六七月间，邓小平副主席在军委扩大会议上作了《军队整顿的任务》的报告。国防科委为贯彻这次会议精神，萧向荣提出：邓副主席关于《军队整顿的任务》的报告，应当看成是军队工作的纲。并由他起草了一个贯彻军委扩大会议精神的《工作纲要》，经党委常委讨论修改通过后，发到所属机关、部队执行。
1975年8月中下旬，国防科委政治部召开体育工作座谈会，学习军委扩大会议文件和叶、邓副主席的讲话。萧向荣到会讲话。他说：“请同志们注意叶副主席的一段话：‘不要简单地把派性看成是闹个人意气、个人地位。他们有些人争权夺利，是野心家，因而搞一些不明白的阴谋诡计，拉山头，组织派别。凡是搞派性的人，必然要搞分裂，从上到下都是这样。资产阶级派性就是分裂党、破坏党的团结和统一。拿派性来压我们的党是不行的！我们党内、军内，也有那么一些人，有了洋房、汽车还不够，还要到处出风头。’叶副主席把派性这样突出来讲，不是没有根据的。”这使到会同志受到启发。
1975年9月24日，萧向荣受国防科委党委常委的委托，在国防科委机关全体干部大会上，作了贯彻军委扩大会议和国防科委进行第二次整顿机关的动员报告。他在报告中提出：整顿机关的主要内容，就是反对和消除资产阶级派性。如再不和资产阶级派性彻底决裂，还继续陷在资产阶级派性的泥坑里不能自拔，对党、对个人都没有好处。他号召大家要下定决心，为消除资产阶级派性、增强党性而奋斗。动员大会之后，在国防科委机关中就撤销了“文化大革命”中产生的领导小组，恢复了各级党委、支部的工作。
经过整顿、反派性，国防尖端科研战线上的各项工作逐步走上了轨道。恰在这时，七机部的帮派头子于1975年10月1日给毛泽东写信，诬告国防科委主任张爱萍推行“今不如昔”的“右倾机会主义路线错误”。毛泽东于11月2日对这封信作了批示：“此人是‘9.16’左派。”毛泽东同时还口头指示：“对张爱萍要帮。”以此为发端，开始了国防尖端科研战线上的“批邓联张’反击右倾翻案风”运动。对此，萧向荣十分沉重地说：国防科研战线上刚刚好转的形势，看来又要遭到破坏了。1975年11月19日，国防科委、七机部联合召开了有八名领导干部参加的会议（即“八人会议”），批判张爱萍。在这个会议上，萧向荣实事求是地说：“张爱萍同志主流是好的，成绩是主要的！”他马上遭到批判。11月底，萧向荣因患重感冒住进医院，高烧不退，转为肺气肿。病情稍有好转，心脏病又严重起来。12月6日，以国防科委党委常委和七机部党组联席会议的形式，继续批判张爱萍。12月13日，王洪文到联席会议上讲话说：“张爱萍的错误实际上是否定‘文化大革命’在国防科委、七机部的伟大胜利，否定整个‘文化大革命’。”自王洪文定调讲话以后，国防科委的帮派头头跑到医院，要萧向荣对“批邓联张”表态。
1976年2月22日，江青、王洪文直接插手，听汇报，发号令。七机部、国防科委的一些帮派头头参与了会议的领导，形成了以帮派压党的形势，左右了会议进展。帮派头头们狂叫：“这场斗争是两个阶级、两个司令部的斗争”，扬言要把扩大会作为解决全党两条路线斗争的一个“重要战场”。他们接连八次提出要萧向荣出院参加扩大会，“揭发”邓副主席和军委聂荣臻副主席。他们以提问题、转达群众意见为名，到医院向萧向荣施加压力。1967年2月6日《人民日报》发表了《文化大革命的继续和深入》的社论，他们又逼萧向荣对“打倒邓副主席”表态。萧向荣说：“毛主席没有指示，中央没有文件，我不能表态。”1976年2月12日，他们又逼迫萧向荣出院参加会议。萧向荣不能安心在医院治疗和休息，于2月20日下午出院。医院在萧向荣的《出院介绍信》上写着：“1）建议全休一个月；（2）防过劳，门诊继续中西药物治疗冠心病；（3）定期复查心电图，心绞痛发作频繁严密观察，防意外发生。”
批判会的主持者虽然看了萧向荣的《出院介绍信》，但为压萧向荣揭发老一辈无产阶级革命家，仍然决定要他参加会议，不准他休息。1976年2月25日下午，扩大会对萧向荣进行批判。2月27日，萧向荣参加小组会时，又受到围攻。他们质问萧向荣：“你说任何人的文章都不能和马列主义著作、毛主席著作相提并论，是指谁的文章？我们这里有无并列的问题？”萧向荣回答：“我怀疑张春桥、姚文元的文章有错误，他们把经验主义说成是主要危险。”为此，萧向荣被围攻了一整天。3月3日下午，萧向荣成了扩大会批判的重点。带着重病参加会议的萧向荣，这时已十分疲惫，回到家时，连楼梯也上不去了。
经过几天的批斗，萧向荣心绞痛发作得日趋频繁。他对夫人说：“现在我觉得身体越来越没有力气，等会议告一段落，我得去休息一个时期。”他还对国防科研、生产战线上逐渐好转的形势，因“反击右倾翻案风”而重新陷入混乱，多次表示痛心和惋惜。1976年3月13日，他们又要萧向荣参加小组会，由群众帮助转弯子。在小组会上，他们围攻追逼萧向荣。小组会后，又责令他到3月18日的扩大会全体会上作检查。17日晚上，萧向荣一手拿着氧气瓶导管吸氧，一手拿着笔写检查稿。夜已经很深了，夫人催他休息，他站了起来，来回踱了几步，非常激动地说：“这样屈辱地活着，还不如死了好！”稍稍停顿了一会儿，又十分严肃地说：“我宁愿站着死，也不愿跪着生！”表达了他对“四人帮”迫害老干部的愤慨。萧向荣写完检查，早已过了午夜，心绞痛发作起来，含过硝酸甘油片后，才逐渐缓解。他上床后，翻来覆去难以入睡。
第二天，吃过早饭，他急急忙忙赶到会场，但会场却空无一人。问过大会工作人员，才知道王洪文要听扩大会的情况汇报，大会推迟一天举行。萧向荣回到家里就病倒了，当天，心绞痛发作了六次。劝他去住医院，他说：“医院也没有好办法。”要请保健医生来，他说：“医生来了也没有特效药。”萧向荣的病情继续恶化。3月19日上午，301医院王士雯军医来给萧向荣看病，认为他的心脏病非常的严重，必须马上住院。这时，扩大会的会场上打来电话，还要萧向荣到大会上去作检查。可是，萧向荣已不能到会了。当日下午萧向荣一住进医院，就确诊为心肌梗塞，医院立即组织抢救。在抢救小组的强烈要求下，3月22日夜，扩大会才派人到医院去看萧向荣，还对他说：“你的问题以后再说。”派来的人走后，萧向荣用微弱的声音，向他身边的工作人员说：“我们在国防科委的工作做得是对的，总有一天会搞清楚！”这是他最后对“四人帮”篡党夺权、破坏国防尖端事业的罪行所作的控诉和声讨。这一夜，他因心情沉重，吃了药，打了针，仍不能入睡。3月23日中午12点45分，萧向荣病情突然恶化，下午2点40分停止了呼吸。一个为了中国人民的解放，为了社会主义、共产主义在中国的胜利，奋斗了整整半个世纪的优秀共产党员的心脏，因为受到严酷的摧残和受尽折磨，而停止了跳动。
萧向荣在革命的一生中，始终孜孜不倦地学习、宣传和捍卫马克思列宁主义、毛泽东思想。对自己承担的事业勇于负责，做出了显著的成绩。他那刻苦读书的精神，勤勤恳恳、精益求精的工作作风，对党忠贞不二的思想品格，感人肺腑。他在顺境中不骄傲，处于逆境时不气馁。他从不计较个人的名誉、地位、得失。在革命斗争的关键时刻，他总是站在马克思主义的立场上，表现了一个共产党人旗帜鲜明、无私无畏、勇于斗争的高尚情操。林彪拉他反对罗瑞卿，他不肯与之同流合污，因而受到暴风雨般的打击，但仍然坚信党，坚信共产主义。在同“四人帮”的斗争中，他勇敢地批判张春桥、姚文元的反党文章，捍卫了马列主义和毛泽东思想。他以浩然正气拒绝为“四人帮”提供打击叶剑英、邓小平和张爱萍等领导同志的材料。在四个月批斗、围攻、追逼的巨大压力下，他表现出光明磊落、坚强不屈的党性。他始终坚持实事求是的原则，宁愿贡献出自己的生命，也不去做损害同志、损害党的事业的事情。
萧向荣逝世半年之后，中国共产党领导全党、全军和全国人民，取得了粉碎“四人帮”反革命集团的伟大胜利。党的十一届三中全会以来，国防尖端科研战线也取得了拨乱反正的巨大胜利，告慰了萧向荣的英魂。
1980年12月27日，《人民日报》发表了张爱萍等为纪念萧向荣而撰写的《忠诚的无产阶级革命战士萧向荣》的文章。这篇文章的标题和内容，真实地反映了萧向荣高尚的思想、卓越的工作和无私无畏的品质。
萧向荣把自己的一生无私地贡献给了人类最美好、最壮丽的共产主义事业，他不愧为忠诚的共产主义战士。
