进入中生代后，现代类型的两栖动物开始出现。现代类型的两栖动物身上光滑而没有鳞甲，皮肤裸露而湿润，布满黏液腺，被归入滑体亚纲。这种皮肤可以起到呼吸的作用，有些两栖动物甚至没有肺而只靠皮肤呼吸。最早的滑体两栖类是三叠纪的原蛙类，如三叠尾蛙，与现代的蛙有些类似，但是有短的尾。有尾目和无足目出现的晚些，有尾目出现于侏罗纪，而无足目到了新生代初期才有可靠的记录，不过无足目特征比较原始，可能更早便已起源。现代两栖动物的起源现在没有定论，有人认为无尾目起源于迷齿类而有尾目和无足目起源于壳椎类，也有人认为三者的共性很多，有着共同的起源。
两栖动物的分类
两栖动物是最原始的陆生脊椎动物，既有适应陆地生活的新的性状，又有从鱼类祖先继承下来的适应水生生活的性状。多数两栖动物需要在水中产卵，发育过程中有变态，幼体（蝌蚪）接近于鱼类，而成体可以在陆地生活，但是有些两栖动物进行胎生或卵胎生，不需要产卵，有些从卵中孵化出来几乎就已经完成了变态，还有些终生保持幼体的形态。
现代的两栖动物种类并不少，超过4000种，分布也比较广泛，但其多样性远不如其他的陆生脊椎动物，只有3个目，其中只有无尾目种类繁多，分布广泛。大致分类有：
迷齿亚纲：最古老的两栖动物，早期两栖动物的主干，生存于泥盆纪到白垩纪，其中包括爬行动物的祖先。
壳椎亚纲：古老而特化的早期爬行动物，仅生存于石炭纪和二叠纪。
滑体亚纲：从三叠纪延续到现代，包括所有现存的两栖动物，分为无足目、有尾目和无尾目。
无足目：无足而形态习性均似蚯蚓的两栖动物，可能历史悠久，但是可靠的化石仅为新生代，现代分布于澳洲以外的热带地区。
吻蚓科：最原始的蚓螈，分布于南美洲。
鱼螈科：较原始的蚓螈，分布于亚洲热带地区，是中国仅有的蚓螈。盲尾蚓科：分布于印度，介于高级和原始的蚓螈之间。
蠕蚓科：分布于赤道非洲的高级的蚓螈。
真蚓科：进步的蚓螈，是蚓螈目种类最多，分布最广的一科，分布于热带美洲、赤道非洲、印度和印度洋岛屿中。
盲游蚓科：唯一的水生蚓螈，分布于南美洲。
有尾目：终生有尾的两栖动物，幼体和成体区别不大，包括各种鲵和蝾螈，出现于侏罗纪，现在主要分布于北半球，特别是北美洲，其次是东亚和欧洲，可分为原始的隐鳃鲵亚目和高级的蝾螈亚目。
隐鳃鲵亚目：主要分布于东亚的原始的有尾两栖动物。
隐鳃鲵科：2属3种，即北美的隐鳃鲵（美洲大鲵）和中国和日本各一种大鲵。
小鲵科：8属30余种，包括小鲵、北鲵、山溪鲵等，主要分布于东亚，北可到北极圈，西到伊朗，我国种类特别丰富。
蝾螈亚目：主要分布于北美洲的进步的有尾两栖动物，其中部分成员是高级类型还是原始类型尚不明确。
鳗螈科：特产于北美洲，身体细长，没有后肢。两栖鲵科：特产于北美洲，生体细长似鳗，四肢很小。
洞螈科：包括欧洲的洞螈和北美洲的泥螈，终生有外鳃的水生两栖动物。钝口螈科：特产于北美洲的穴居蝾螈，其中有些种类可终生保持幼体特征，生活于水中。
陆巨螈科：特产于北美洲的穴居蝾螈，与钝口螈比较相似。
无肺螈科：有尾亚目中的最大一科，主要分布于北美洲，少数分布于欧洲和中南美洲，也是中南美洲仅有的有尾亚目。
蝾螈科：分布最广泛的有尾两栖动物，主要分布于欧亚大陆，也见于北非和北美。
无尾目：包括各种蛙和蟾蜍，幼体和成体区别甚大，仅蝌蚪有尾。出现于三叠纪，现代绝大多数两栖动物均属此类，世界性分布，但在拉丁美洲最丰富，其次是非洲。无尾目可分为始蛙亚目和新蛙亚目，或进一步将始蛙亚目划分为始蛙亚目、负子蟾亚目和锄足蟾亚目。对于科的划分也有一些不同意见。
始蛙亚目：始蛙亚目被认为是比较原始的特征，其成员有未与脊椎愈合的肋骨出现，代表无尾目中比较原始的类型，其中滑跖蟾类被认为是最原始无尾目。
滑跖蟾科：最原始的无尾目，包括新西兰的滑跖蟾和北美洲的尾蟾，二者有时列为单独的科。
盘舌蟾科：中国最原始的无尾目，包括铃蟾和盘舌蟾，二者有时列为单独的科。
负子蟾亚目：共有4属27种，包括南美洲的负子蟾和非洲的3属爪蟾。负子蟾科的成员均完全水生性，后肢强劲而有发达的蹼，前肢纤细而无蹼，没有舌头。
负子蟾科：原始的无尾目，包括南美洲的负子蟾和非洲的爪蟾。异舌蟾科：仅以墨西哥的异舌穴蟾为代表，有时被并入负子蟾科。
锄足蟾亚目：有2属10种，其跖突发达，适合挖洞穴居，包括欧洲、西亚和非洲西北部的4种锄足蟾和北美洲的6种掘足蟾。
锄足蟾科：包括锄足蟾和角蟾，二者有时列为单独的科，其中角蟾在我国特别丰富。
合附蟾科：在欧洲和高加索地区各有一种，有时被并入锄足蟾科。
新蛙亚目：新蛙亚目包括了无尾目中96％的种类，其分布遍及世界各地，甚至包括一些偏僻的岛屿，成员主要分布于热带地区和南半球，其中以拉丁美洲种类最为丰富。
细趾蟾科：两栖动物的最大一科，包括多种似蛙和蟾蜍的动物，分布于南美洲。
龟蟾科：分布于大洋洲，是细趾蟾在大洋洲对应的成员。
塞舌蛙科：分布于塞舌尔群岛，分类地位不定，可能与龟蟾有一定亲缘关系。
沼蟾科：分布于非洲最南部，分类地位不定，可能与龟蟾有一定亲缘关系。雨蛙科：两栖动物的第二大科，分布广泛的树栖蛙类，多数分布于美洲，其次是大洋洲，其中大洋洲的成员有时单列为一科。附蛙科：拉丁美洲的小型树栖蛙类。
疣蛙科：南美洲的小科。
短头蟾科：南美洲的小科，体型微小。
达尔文蛙科：南美洲的小科。
多指节蟾科：南美洲的小科，即著名的不合理蛙，蝌蚪要比成蛙大很多。箭毒蛙科：拉丁美洲的小型蛙类，以毒性强烈著称。
蟾蜍科：分布广泛的
大科，但不出现于澳洲、马达加斯加和一些大洋岛屿。
蛙科：分布最广泛的两栖动物，几乎遍及各大洲，也出现在一些岛屿上，最北达到北极圈，而在澳洲则只出现在最北方。
树蛙科：亚洲和非洲热带地区的树栖蛙类，形态习性接近雨蛙，但亲缘关系接近蛙科。
非洲树蛙科：非洲及附近岛屿的树栖和陆栖蛙类。节蛙科：非洲的蛙类，有时被并入蛙科。
姬蛙科：一大科分布广泛的小型蛙类，包括两栖动物中最多的属。
两栖动物的特征
两栖动物是人们熟知的一类动物，是脊椎动物进化史上由水生向陆生的过渡类型，成体可适应陆地生活，但繁殖和幼体发育还离不开水。主要的特征是：体温不恒定，卵生，幼体在水中生活，经变态后成体可适应陆地生活，用肺呼吸，皮肤裸露而湿润，无鳞片、毛发等皮肤衍生物，黏液腺丰富，具有辅助呼吸功能。
两栖动物最初出现于古生代的泥盆纪晚期，最早的两栖动物牙齿有迷路，被称为迷齿类，在石炭纪还出现了牙齿没有迷路的壳椎类，这两类两栖动物在石炭纪和二叠纪非常繁盛，这个时代也被称为两栖动物时代。在二叠纪结束时，壳椎类全部灭绝，迷齿类也只有少数在中生代继续存活了一段时间。
进入中生代以后，出现了现代类型的两栖动物，其皮肤裸露而光滑为主要特征，被称为滑体两栖类。
其主要特征有：变态发育，幼体生活在水中，用鳃呼吸；大多数生活在陆地上，少数种类生活在水中，一般用肺呼吸；皮肤裸露，能分泌黏液，有辅助呼吸的作用；心脏两心房，一心室，不完全的双循环；体温不恒定；体外受精；先长出后肢，再长出前肢；抱对受精。
