在1994—1996年和1999—2000年的两次车臣战争中，阿尔法更是锋芒重现。1995年6月14日，车臣匪首巴萨耶夫率200余名武装匪徒，乘车潜入俄南部城市布琼诺夫斯克，劫持了近千名政府工作人员和医务人员及病人为人质，要挟俄政府停止进攻格罗兹尼。阿尔法别动队受命来到车臣战场。歼敌任务异常艰巨，好在最后联邦政府采取了退让政策，才使几十名特种队员免于付出巨大牺牲。1996年，车臣另一匪首拉杜耶夫率领600余名匪徒冲入基兹利亚尔市，把3000名医生、护士及市民绑为人质。阿尔法别动队担任强攻突击群的第二梯队，负责最后解救人质。经过殊死搏斗，人质终获自由。
智慧——绝技——炼狱
阿尔法队员个个身怀绝技，这完全得益于近乎苛刻的挑选和炼狱般的训练。阿尔法队员的挑选十分严格，通常是从国家安全机关、空降兵、边防部队、军校毕业生中的优秀年轻军官中考核筛选，年龄限制在23—28岁之间，一般是数十名候选者中间才能选拔出一人。入选者必须体格健壮，反应灵敏。另外，入选者还要通过个性测试和面试，从而测出其智力程度。之所以要测试智力，是因为阿尔法认为在反恐怖行动中，不光需要技艺和武功，还需要精明的头脑，队员不应是行动的机器，而应是智慧型的人才，在异常严峻的环境下，需要队员冷静分析局势，找出最适宜的降敌办法，作出最明智的决策。阿尔法队员一般到35岁就要退役，前后只有10年左右服役时间。在这十年间，至少前5年主要用于训练。
阿尔法别动队的训练分体能训练、基本技能训练、心理训练和特种技能训练。训练的宗旨是培养队员的单兵作战能力、协同作战能力和勇于牺牲的精神。每名队员都必须百分之百地相信自己的同事，因为这不仅事关他自己的生命安全，更关系到整个别动队任务的完成。学员分到别动队后，首先进行射击、越野、汽车驾驶和跳伞等科目训练。阿尔法还用其他国家特种部队的训练经验训练队员，全部队员都善于在狭小空间内同武装分子搏斗。阿尔法别动队的训练主题是射击，训练结束后每个队员都要成为弹无虚发的神枪手。别动队每月进行一次技能考核，以使队员巩固和掌握各种实战技能，未能达标者限期赶上，否则一律除名。每名队员配备一部对讲机，一出现危险情况，全队从接到命令到齐装满员地登机前往出事地点只需1—1.5小时。别动队的每名队员都要学习犯罪心理学，进行谈判和心理战方面的训练。
阿尔法别动队的250名队员中，个个身怀绝技，既有百发百中的狙击手、胆大心细的爆破手，也有业务纯熟的无线电报务员、技能高超的解密专家，还有攀岩高手“壁虎”和水中蛟龙“蛙人”。阿尔法反恐怖别动队每位成员都配备一支马卡洛夫手枪、微型冲锋枪、多用途匕首、特制手榴弹、机动通信工具等全套轻型特种作战装具。为了有效地控制各种局面，阿尔法小组还配备了各种特殊的反恐怖兵器，如特制的手榴弹和特种杀伤武器等。此外，为了应付日益复杂的恐怖活动和狡诈残忍、装备先进的匪徒，俄罗斯日前又为包括阿尔法在内的所有特种部队研制并装备了新型防弹背心、短身枪、夜视仪，以及能从空中打击隐藏在建筑物、墙壁、障碍物之后的恐怖分子的新式武器。前不久，阿尔法别动队还配发了一种叫做“佩尔森”的电子按钮，它可用以对恐怖分子的遥控爆炸装置实施干扰，从而使之失灵。
近年来，中亚地区及俄罗斯境内恐怖活动十分猖獗，仅近几年来俄罗斯就爆发了十几起严重的劫机、暗杀、爆炸、绑架等极端恐怖活动，阿尔法别动队对于变动中的俄罗斯社会局势，将起到重要作用。
外战专家——信号旗特种部队
俄罗斯有两把打击恐怖主义活动的“尖兵利剑”，一个是闻名遐迩的阿尔法特种部队，另一个就是联邦安全局属下的信号旗特种部队。二者的最大区别是前者主要在国内从事反恐怖活动，后者则在国外专门进行反颠覆和警戒俄罗斯驻外目标。由于阿尔法近年来多有披露，其行动也受到众人关注，因而许多人对它耳熟能详。但对信号旗特种部队却少有所闻，原因是自组建之日起，它就是一支神秘的超级特种部队，很少公开露面，加之大多在俄罗斯境外行动，所以信号旗特种部队始终披着一层神秘的面纱。只是最近几年，俄罗斯许多报纸杂志相继介绍了有关这支神秘部队的行动资料，才使得信号旗的神秘面纱渐渐撩开。
秘密组建
20世纪七八十年代，苏联阿尔法特种部队在国内反恐怖战场上屡立奇功，令猖獗一时的恐怖分子闻风丧胆，这也令苏联领导人很受鼓舞。尤其是阿尔法特种部队勇夺阿富汗首府阿明宫的成功，使苏联领导人更加觉得，建立一支专门执行境外特种作战任务的部队是十分必要的。之后不久，随着国际斗争形势的发展，苏联领导人决定正式建立一支专门用于境外的特种部队，这支特种部队就是现在的信号旗特种部队。
1981年8月19日，苏联部长会议和苏共中央政治局举行秘密会议，商讨在克格勃系统内秘密组建一支“绝密支队”，专门用于在境外从事秘密特工活动。苏联最高领导人的决定得到了与会代表的一致同意，并委托克格勃“C”局具体负责组建特种部队。新的特种部队取名为“信号旗”，由攻打阿明宫的英雄、海军少将埃瓦尔德·科兹洛夫负责指挥。在组织编制上，信号旗特种部队列入克格勃“C”局，即境外秘密谍报局。
除少数人外，没有人知道信号旗特种部队的存在。它的名称是“苏联克格勃独立训练中心”，部队番号为35690，后来改为5555。信号旗特种部队通常以班为单位进行活动，在战斗时，以小组为单位行动。每个班的人数从10人到30人不等。情况紧急或需要时，几个班就可迅速联合在一起，组成一支较大规模的部队。
严格遴选
信号旗特种部队的队员选拔十分严格，不仅政治上要合格，绝对忠于祖国，效忠国内最高领导人的指示，而且要具有优秀的业务素质、身体素质和心理素质，熟悉某国的风土人情。对于候选人员，首先是调查他的档案，然后进行面谈。条件符合要求的候选人报克格勃领导审批。之后是为期两个月的试训和考试。考试合格后，这些候选人被正式录用，成为信号旗特种部队的一员。到1991年初，信号旗特种部队已发展到1200多人，其中90％的队员是军官，士兵和准尉只能在保障分队里服役。由于时间紧张，信号旗首批队员首先从“天顶”和“瀑布”特种部队中挑选。以后主要从国家安全机关、空降兵、边防军、中级军事院校优秀毕业学员中遴选。年龄限制在22—27岁之间，一般15—20个候选人之间才能选中一个，到35岁退役，前后只有10年左右的服役时间，而且前5年主要用于训练。
挑选信号旗特种部队队员的另一个重要的条件是外语知识。一般候选人员要懂两门外语。其中，一门外语要精通，第二门外语应能借助词典翻译书面材料。
刻苦训练
如同阿尔法特种部队一样，信号旗特种部队的队员都是“超人”，个个骁勇善战，人人身怀绝技，这主要是严格训练的结果。入选信号旗特种部队之后，所有队员都要重新进行基础教育培训、特种教育培训和专业技能培训。虽然信号旗所有队员都受到了高等教育，但还必须花费很长时间去训练，才能成为“秘密战的职业队员”。
信号旗特种部队的训练科目包括一般体能训练、徒手格斗、射击训练、驾驶、地雷爆破、使用电台、小分队战术、侦察、空降、攀岩、游泳、医疗救护等。以上各种技能只有通过号称“炼狱”的4个训练阶段才能完全掌握。
第一阶段为基础训练阶段，队员全副武装地进行10—15公里的越野和急行军，穿越莽莽原始森林和沼泽地带。训练时，要求队员在充满腐烂尸体、水蛇、尖桩和陷阱的泥水中匍匐前进。此时，要求队员克服极度恐惧心理，处处小心，以防掉进预先设置的陷阱，从而失去继续参训的机会。
第二阶段为生存和耐力训练。队员在漫无边际的荒野里就地取食谋生，与此同时还要在有敌人追击的情况下巧妙地隐蔽自己。
第三阶段为特殊条件下的行动训练。在某一特种训练中心，信号旗部队完全按照某些国家的地形地貌和主要城镇，以及风土人情等进行设计，就连街名等也与那个国家一模一样。要求信号旗队员针对不同“国家”进行针对性训练。队员身临其境，好像真的到了该国。此时，队员被要求讲该国语言，还要讲地方土语，同时还要执行诸如到某处去送秘密情报等特殊任务。
第四阶段为实战训练。包括徒手格斗、射击训练、驾驶训练、地雷爆破训练和电台训练。
如果说信号旗特种部队在国内主要是训练的话，那么在国外就是真刀实枪的战斗，那时队员们凭借的绝对是平时练就的基本功和潜能。通常情况下，信号旗队员在国外执行任务的时间大都为半年，有时会稍长一点。
信号旗队员被派往国外都是秘密进行的。在那里，他们迅速且仔细地熟悉和了解某个日后将要消灭、炸毁或保护的使馆、领馆、核电站和通信枢纽等设施。这时，他们所用的不是地图，也不是看录像，而是实地勘察。有时，信号旗队员被派到古巴、尼加拉瓜、越南等国，与其侦察破坏部队进行联合演习，而在安哥拉和莫桑比克则充当军事顾问，在原东德和罗马尼亚与同行搞反恐怖演习。
屡建战功
如同阿尔法特种部队一样，信号旗特种部队接受的首次严峻考验是在阿富汗。
在阿富汗战争中，信号旗特种部队的主要任务是进行秘密破坏活动和搜集情报。为此，参战的信号旗特种部队的队员多次深入敌后，对阿富汗游击队进行分化瓦解，散布假情报，以及解救人质，多次出色地完成了任务。
1981—1991年间，信号旗特种部队的主要任务是在苏联境外进行侦察破坏活动，以及其他特种行动。具体包括：打击恐怖组织和游击队，保护苏联境外居民和机关，破坏敌人的重要战略设施，如交通枢纽、核电站、水电站、化学和石油企业，保护苏联的战略目标，帮助友好国家解救人质，扣押敌国飞机和军舰等。
1991年后，信号旗特种部队开始用于对付核恐怖主义，并有针对性地进行了一系列的训练。经过10年的秘密训练，信号旗已经成为一支作战能力很强的特种部队，毫不逊色于美国的捷尔塔特种部队和英国的CAC部队，而且在许多方面都超过了这两支特种部队。1993年6月，几名恐怖分子劫持了一艘核动力船，信号旗特种部队奉命赶到。几名队员神不知鬼不觉地接近了核动力船，另外几名“蛙人”以特殊方法潜到了船舷两侧，以迅雷不及掩耳之势拿下了船上的外围警戒。紧接着，几名空降兵从天而降。十几分钟之后，几名恐怖分子被押到了岸上。值得一提的是，当时的海上风速达到每秒15米，而一般情况下，在风速为每秒10米时，就连专业跳伞员也要停止训练，信号旗队员硬是在这样的海上风速条件下完成了准确降落动作。
苏联解体后，信号旗特种部队的任务发生了变化，主要是开始转入打击恐怖分子、武装犯罪和大规模有组织犯罪，并多有杰作。1992年，10名信号旗特种部队队员在莫斯科“三个车站”地铁站10秒钟之内就制伏了14名武装暴徒，缴获100万假美金。1993年，信号旗特种部队在叶卡捷琳堡郊外成功地预先制止了一起恐怖爆炸事件。
散了又建
1993年10月，信号旗和阿尔法特种部队违抗叶利钦总统的命令，拒绝攻打“白宫”。叶利钦对此大为不满，于年底签署命令改组信号旗特种部队，将其转隶俄罗斯内务部。这一举动，引起多数队员的不满。112名军官递交辞呈报告，150多名队员转调其他安全部门。而有一些队员则干脆彻底转到了地方工作，开始经商赚钱。此后，信号旗特种部队曾一度销声匿迹。
到了1994年，俄罗斯国内恐怖事件接连发生，造成全国的极度恐慌。出于国内反恐怖和反间谍斗争的需要，俄罗斯政府决定重新组建信号旗特种部队。当时，联邦安全总局决定在其反间谍处组建一个新的特种行动支队，下辖若干分队，然后派往全国各地执行反恐怖和反颠覆破坏行动。于是，转到其他部门的原信号旗的队员纷纷被从内卫部队和安全局及边防军部队中召回，他们被安排到重新组建的信号旗各分队担任指挥员职务。为了确保核设施安全，信号旗还专门组建了一个代号为“韦嘉”的分队，聘请反核恐怖专家担任顾问，专门守护俄罗斯的核设施。
1994年秋末冬初，第一次车臣战争爆发以后，重新组建的信号旗特种部队被派往硝烟弥漫的车臣战场。在战争环境中，信号旗同样经受住了血与火的考验，他们多次执行了极为危险的特种作战任务，多次解救人质，可谓大显身手，为消灭车臣非法武装分子立下了赫赫战功。
俄罗斯海狗特种部队
尽管以前俄罗斯政府矢口否认这支被外界称为“海狗”的特种部队存在，但是一些曾在该特种部队服过役的官兵们，不久前终于打破沉默，公开向外界宣布了他们的存在。
这支神秘的特种部队早在1941年就成立了。当时在德军重重包围之下的列宁格勒，由苏联海军抽调人力组成了一个特种连，专门在敌后从事破坏活动。其实这并不是什么新鲜事，意大利和英国早就组建了类似的部队，其主要任务是在舰艇附近和水利工程中布雷和组织其他破坏活动。
俄罗斯海军特种部队除了担负海上警戒工作外（比如前苏联领导人戈尔巴乔夫与美国总统布什在雷克雅未克马其顿会谈时，负责戈尔巴乔夫乘坐专轮水下警戒任务的就是海军的“海狗”部队），还要完成许多其他任务。其中包括搜寻海上失踪者和沉在浅海的飞行器，使未爆炸的弹药失效，与内务部队协同在多林的山区搜索危险的罪犯，消除技术灾难的后果等等。
军中的精英
那么，俄罗斯海狗特种部队也就是海军特种部队，都是由一些什么人组成的呢？海军特种部队的队员们首先是职业的高级侦察员。这些人要完成很广泛的任务，除了接受潜水训练之外，还必须有渊博的知识。这些知识有时看起来与他们的职业没有任何联系，如学习物理、化学，接受工程训练等等。但是关键时刻，这些知识总是能帮上他们的大忙。
